More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4098 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  66.49 
 
 		 608 aa  719    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  66.25 
 
 		 594 aa  758    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  64.37 
 
 		 608 aa  684    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  70.03 
 
 		 597 aa  794    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  66.25 
 
 		 594 aa  758    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  66.43 
 
 		 594 aa  761    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  64.25 
 
 		 951 aa  1161    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  59.38 
 
 		 597 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  100 
 
 		 950 aa  1855    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  65.73 
 
 		 613 aa  718    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  66.43 
 
 		 594 aa  760    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  65.09 
 
 		 594 aa  762    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  64.92 
 
 		 594 aa  761    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  66.25 
 
 		 594 aa  758    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  65.77 
 
 		 594 aa  768    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  62.71 
 
 		 593 aa  725    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  64.36 
 
 		 594 aa  759    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  52.81 
 
 		 954 aa  909    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  59.11 
 
 		 598 aa  696    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  66.43 
 
 		 594 aa  760    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  60.68 
 
 		 631 aa  649    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  65.26 
 
 		 594 aa  769    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  63.15 
 
 		 599 aa  746    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  66.25 
 
 		 594 aa  758    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  64.6 
 
 		 617 aa  738    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  59.42 
 
 		 588 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  65.26 
 
 		 594 aa  761    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  72.56 
 
 		 604 aa  823    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  65.26 
 
 		 594 aa  764    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  65.26 
 
 		 594 aa  761    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  61.34 
 
 		 630 aa  674    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  66.02 
 
 		 594 aa  757    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  65.61 
 
 		 594 aa  773    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  66.49 
 
 		 608 aa  719    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  65.09 
 
 		 594 aa  759    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  56.97 
 
 		 589 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  57.19 
 
 		 589 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  56.07 
 
 		 590 aa  632  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  57.32 
 
 		 590 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  60 
 
 		 608 aa  631  1e-179  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  56.34 
 
 		 589 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  57.32 
 
 		 590 aa  621  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  60.75 
 
 		 625 aa  606  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  53.07 
 
 		 589 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  52.85 
 
 		 583 aa  595  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  54.23 
 
 		 595 aa  584  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  57.98 
 
 		 586 aa  581  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  51.59 
 
 		 589 aa  556  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  51.38 
 
 		 604 aa  541  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  51.87 
 
 		 590 aa  536  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.13 
 
 		 596 aa  515  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2942  inner-membrane translocator  71.3 
 
 		 345 aa  429  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1518  inner-membrane translocator  67.54 
 
 		 345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0025  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  61.19 
 
 		 351 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3908  inner-membrane translocator  60.97 
 
 		 351 aa  383  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01744  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  60.85 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.698868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3236  inner-membrane translocator  59.14 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3363  inner-membrane translocator  63.06 
 
 		 350 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1821  inner-membrane translocator  57.1 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.683409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3042  inner-membrane translocator  60.34 
 
 		 351 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3512  inner-membrane translocator  63.14 
 
 		 350 aa  373  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0408964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0801  inner-membrane translocator  59.65 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0091  inner-membrane translocator  59.83 
 
 		 351 aa  366  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1229  inner-membrane translocator  61.74 
 
 		 342 aa  365  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4526  inner-membrane translocator  61.52 
 
 		 350 aa  365  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141329  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4658  inner-membrane translocator  61.52 
 
 		 350 aa  365  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.14788 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0081  inner-membrane translocator  59.83 
 
 		 351 aa  364  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0090  inner-membrane translocator  57.83 
 
 		 351 aa  363  8e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3272  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  60.06 
 
 		 351 aa  362  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0268  inner-membrane translocator  56.78 
 
 		 345 aa  362  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0990  inner-membrane translocator  60.46 
 
 		 345 aa  357  5.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2941  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  59.14 
 
 		 351 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0193  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  59.14 
 
 		 351 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3370  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  59.14 
 
 		 351 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3000  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  59.14 
 
 		 351 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.403467  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1602  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  59.14 
 
 		 351 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3985  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  59.71 
 
 		 351 aa  356  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4059  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  58.86 
 
 		 351 aa  355  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3323  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  60 
 
 		 397 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0573  inner-membrane translocator  61.16 
 
 		 342 aa  351  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0107  inner-membrane translocator  59.83 
 
 		 351 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2965  inner-membrane translocator  59.54 
 
 		 394 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235343  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0090  inner-membrane translocator  59.54 
 
 		 394 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  39.01 
 
 		 599 aa  347  8.999999999999999e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3952  inner-membrane translocator  57.3 
 
 		 360 aa  343  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  35.27 
 
 		 614 aa  327  5e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0693  inner-membrane translocator  49.29 
 
 		 349 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7085  ABC transporter, permease protein  56.01 
 
 		 341 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3571  inner-membrane translocator  55.2 
 
 		 346 aa  320  6e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1995  inner-membrane translocator  54.91 
 
 		 346 aa  320  6e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  38.05 
 
 		 593 aa  320  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5328  inner-membrane translocator  56.73 
 
 		 345 aa  318  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0654205  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  38.23 
 
 		 606 aa  313  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0996  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  50.29 
 
 		 357 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.883581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  37.35 
 
 		 593 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3249  branched chain amino acid ABC transporter permease  50.72 
 
 		 347 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174248  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4633  inner-membrane translocator  53.04 
 
 		 345 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0776  inner-membrane translocator  52.75 
 
 		 345 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.300879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2424  inner-membrane translocator  60.29 
 
 		 349 aa  302  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.69608  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  33.38 
 
 		 663 aa  302  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>