More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0694 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  100 
 
 
583 aa  1164    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  52.85 
 
 
950 aa  595  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  53.08 
 
 
594 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  53.08 
 
 
594 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  53.6 
 
 
594 aa  595  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  52.91 
 
 
594 aa  591  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  53.5 
 
 
594 aa  588  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  53.42 
 
 
594 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  53.68 
 
 
594 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  53.5 
 
 
594 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  52.91 
 
 
594 aa  588  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  53.5 
 
 
594 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  53.5 
 
 
594 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  53.25 
 
 
594 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  53.25 
 
 
594 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  53.08 
 
 
594 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  53.08 
 
 
594 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  53.25 
 
 
594 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  53.25 
 
 
594 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  53.08 
 
 
594 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  51.03 
 
 
593 aa  566  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  52.39 
 
 
590 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  53.33 
 
 
589 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  50.77 
 
 
951 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  49.31 
 
 
598 aa  555  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  52.64 
 
 
589 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  52.32 
 
 
589 aa  554  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  50.43 
 
 
604 aa  550  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  51.54 
 
 
617 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  52.1 
 
 
597 aa  542  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  51.45 
 
 
608 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  51.45 
 
 
613 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  51.45 
 
 
608 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  49.32 
 
 
597 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  52.33 
 
 
608 aa  532  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.56 
 
 
596 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  47.41 
 
 
599 aa  526  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  49.31 
 
 
589 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  51.98 
 
 
608 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  49.4 
 
 
590 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  50 
 
 
588 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  50.8 
 
 
590 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  48.58 
 
 
589 aa  499  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  48.75 
 
 
630 aa  500  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  50.36 
 
 
595 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  49.29 
 
 
954 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  47.84 
 
 
604 aa  470  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  47.77 
 
 
631 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  47.06 
 
 
590 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  48.3 
 
 
586 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  47.86 
 
 
625 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  38.53 
 
 
614 aa  306  7e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  34.74 
 
 
663 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  33.49 
 
 
643 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  38.49 
 
 
612 aa  277  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  35.57 
 
 
593 aa  277  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  35.57 
 
 
593 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  33.9 
 
 
599 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  32.81 
 
 
648 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  34.62 
 
 
647 aa  271  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.82 
 
 
646 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  33.98 
 
 
646 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  36.33 
 
 
823 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  36.17 
 
 
823 aa  267  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  32.7 
 
 
643 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  34.58 
 
 
606 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  56.05 
 
 
255 aa  262  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  36.05 
 
 
608 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  36.5 
 
 
827 aa  259  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  34.35 
 
 
593 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  32.74 
 
 
660 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  33.77 
 
 
616 aa  253  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  34.08 
 
 
610 aa  253  8.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  53.01 
 
 
255 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  51.2 
 
 
256 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  35.18 
 
 
611 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  34.98 
 
 
624 aa  246  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  52.61 
 
 
255 aa  246  9e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  35.41 
 
 
832 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  34.29 
 
 
679 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  51.59 
 
 
255 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  32.72 
 
 
603 aa  243  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.2 
 
 
256 aa  242  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  50.8 
 
 
257 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  49.2 
 
 
261 aa  239  9e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  50.8 
 
 
257 aa  239  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  34.27 
 
 
678 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  32.09 
 
 
582 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  34.15 
 
 
830 aa  237  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  34.05 
 
 
621 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  49.8 
 
 
255 aa  236  7e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  32.48 
 
 
632 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  32.4 
 
 
842 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  34.72 
 
 
611 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  49.6 
 
 
258 aa  232  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
256 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  46.77 
 
 
251 aa  233  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  50 
 
 
256 aa  231  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  51.19 
 
 
252 aa  227  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  48.59 
 
 
255 aa  226  8e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>