More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3205 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  522  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  72.16 
 
 
255 aa  388  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  73.23 
 
 
255 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  71.26 
 
 
255 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  63.78 
 
 
255 aa  338  5.9999999999999996e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  62.35 
 
 
256 aa  334  7e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  57.87 
 
 
275 aa  289  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  57.87 
 
 
275 aa  289  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  57.87 
 
 
275 aa  289  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  57.31 
 
 
293 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  56.92 
 
 
283 aa  285  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  55.6 
 
 
271 aa  281  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  55.78 
 
 
265 aa  277  9e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  55.95 
 
 
333 aa  277  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  55.38 
 
 
264 aa  277  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  54.22 
 
 
255 aa  276  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  56.13 
 
 
280 aa  275  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  55.16 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  52.82 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  54.8 
 
 
270 aa  273  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  53.28 
 
 
261 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  51.78 
 
 
271 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  53.57 
 
 
258 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  53.88 
 
 
261 aa  269  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  53.57 
 
 
261 aa  268  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  53.04 
 
 
258 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  52.82 
 
 
256 aa  267  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  53.6 
 
 
259 aa  266  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  54.03 
 
 
257 aa  265  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  54.18 
 
 
259 aa  265  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  53.17 
 
 
276 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.23 
 
 
258 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  52.23 
 
 
258 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  52.23 
 
 
258 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  52.23 
 
 
258 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  55.43 
 
 
294 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  54.98 
 
 
255 aa  263  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  55.38 
 
 
254 aa  263  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  52.92 
 
 
270 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  52.73 
 
 
273 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  56.05 
 
 
583 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  50 
 
 
251 aa  263  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  51.42 
 
 
258 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  51.42 
 
 
258 aa  260  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  50.99 
 
 
255 aa  260  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.81 
 
 
258 aa  260  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  51.21 
 
 
250 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  53.63 
 
 
253 aa  260  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  54.12 
 
 
262 aa  260  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  52.99 
 
 
257 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  51.79 
 
 
258 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  55.2 
 
 
257 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  51.81 
 
 
259 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  51.19 
 
 
263 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  51.81 
 
 
256 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  50 
 
 
259 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  51.39 
 
 
255 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  51.81 
 
 
255 aa  255  4e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 
254 aa  255  5e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  51.61 
 
 
258 aa  255  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  51.42 
 
 
268 aa  255  5e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  51 
 
 
255 aa  255  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  49.8 
 
 
256 aa  255  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  48.96 
 
 
302 aa  255  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  50.6 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  51.61 
 
 
260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  50.81 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  51.42 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  50.81 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  52.42 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  48.26 
 
 
307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  49.8 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  50.59 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  51.79 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.63 
 
 
257 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.63 
 
 
257 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  51.39 
 
 
258 aa  252  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  52.42 
 
 
250 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  50.97 
 
 
262 aa  252  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  52.63 
 
 
257 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 
255 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 
257 aa  252  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.63 
 
 
257 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.63 
 
 
257 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  52.23 
 
 
258 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  51.39 
 
 
258 aa  252  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  52.23 
 
 
258 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.63 
 
 
257 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  51.38 
 
 
259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.42 
 
 
257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  53.44 
 
 
271 aa  252  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  48.8 
 
 
256 aa  251  6e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  51.18 
 
 
261 aa  251  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 
255 aa  251  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.2 
 
 
255 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 
255 aa  251  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  52.23 
 
 
257 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2268  ABC transporter related  53.54 
 
 
262 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>