More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1697 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  70.05 
 
 		 611 aa  720    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  71.51 
 
 		 611 aa  711    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  100 
 
 		 593 aa  1177    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  71.88 
 
 		 608 aa  740    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  43.3 
 
 		 599 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  34.3 
 
 		 648 aa  325  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  35.4 
 
 		 663 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  35.7 
 
 		 590 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  35.24 
 
 		 593 aa  316  8e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  33.38 
 
 		 643 aa  312  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  34.28 
 
 		 643 aa  311  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  34.57 
 
 		 646 aa  309  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  36.2 
 
 		 682 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  34.52 
 
 		 598 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  33.96 
 
 		 647 aa  306  9.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  36.31 
 
 		 679 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  38.68 
 
 		 823 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  38.68 
 
 		 823 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  35.48 
 
 		 594 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.48 
 
 		 594 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  35.51 
 
 		 589 aa  301  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  37.88 
 
 		 593 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.48 
 
 		 594 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.48 
 
 		 594 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.3 
 
 		 594 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  35.3 
 
 		 594 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.3 
 
 		 594 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  34.63 
 
 		 589 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  35.22 
 
 		 594 aa  300  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  37.63 
 
 		 593 aa  299  8e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  35.24 
 
 		 594 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  34.96 
 
 		 594 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.1 
 
 		 594 aa  298  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  36.4 
 
 		 608 aa  298  3e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  34.98 
 
 		 594 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  34.57 
 
 		 594 aa  297  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  34.75 
 
 		 594 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  34.98 
 
 		 594 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.29 
 
 		 646 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  35.51 
 
 		 678 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  38.14 
 
 		 606 aa  296  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  34.57 
 
 		 594 aa  294  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  35.14 
 
 		 589 aa  293  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.03 
 
 		 594 aa  292  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1697  ABC transporter-related protein  36.21 
 
 		 652 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  36.05 
 
 		 652 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  34.65 
 
 		 589 aa  290  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  33.96 
 
 		 588 aa  290  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  34.72 
 
 		 954 aa  290  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  36.38 
 
 		 612 aa  287  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  36.38 
 
 		 599 aa  287  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  34.2 
 
 		 594 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  33.22 
 
 		 950 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  34.24 
 
 		 589 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  36.04 
 
 		 832 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  38.4 
 
 		 827 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  37.79 
 
 		 822 aa  279  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  37.26 
 
 		 610 aa  279  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  35.43 
 
 		 590 aa  276  6e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  33.94 
 
 		 617 aa  276  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  33.89 
 
 		 603 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  34.56 
 
 		 630 aa  273  8.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  35.69 
 
 		 631 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  33.28 
 
 		 604 aa  270  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  34.8 
 
 		 590 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  33.75 
 
 		 951 aa  270  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  34.19 
 
 		 614 aa  270  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  32.65 
 
 		 660 aa  269  8.999999999999999e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  33.78 
 
 		 624 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  34.66 
 
 		 590 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5601  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 563 aa  267  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  35.34 
 
 		 830 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  34.35 
 
 		 583 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  36.19 
 
 		 625 aa  264  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  36.11 
 
 		 586 aa  263  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  34.45 
 
 		 859 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  32.01 
 
 		 608 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  32.01 
 
 		 608 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1684  ABC transporter related  33.61 
 
 		 629 aa  257  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0459583  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  31.4 
 
 		 597 aa  257  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  35.2 
 
 		 595 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  35.73 
 
 		 604 aa  254  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  33.87 
 
 		 613 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  33.71 
 
 		 852 aa  251  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0478  ABC transporter related  33.17 
 
 		 634 aa  248  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  32.99 
 
 		 608 aa  247  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  31.25 
 
 		 597 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  32.42 
 
 		 616 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.22 
 
 		 609 aa  243  7e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2146  ABC transporter related  32.61 
 
 		 606 aa  242  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  31.13 
 
 		 842 aa  239  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  34.63 
 
 		 828 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  31 
 
 		 603 aa  237  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.5 
 
 		 596 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  31.32 
 
 		 838 aa  234  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  33.56 
 
 		 840 aa  233  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  29.02 
 
 		 565 aa  233  9e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  31.27 
 
 		 840 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  33.69 
 
 		 840 aa  228  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  31.28 
 
 		 594 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>