More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4632 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  58.68 
 
 		 594 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  57.5 
 
 		 950 aa  647    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  58.85 
 
 		 594 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  59.69 
 
 		 594 aa  677    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  59.69 
 
 		 594 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  60.21 
 
 		 594 aa  677    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  58.23 
 
 		 590 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  59.07 
 
 		 594 aa  672    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  58.68 
 
 		 594 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  59.28 
 
 		 589 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  100 
 
 		 590 aa  1150    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  58.85 
 
 		 608 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  60.03 
 
 		 594 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  58.85 
 
 		 608 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  59.69 
 
 		 594 aa  679    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  58.85 
 
 		 594 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  58.68 
 
 		 594 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  58.85 
 
 		 594 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  93.22 
 
 		 590 aa  1007    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  59.25 
 
 		 589 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  59.41 
 
 		 589 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  60.21 
 
 		 594 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  58.68 
 
 		 594 aa  665    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  60.38 
 
 		 594 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  60.21 
 
 		 594 aa  675    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  60.38 
 
 		 594 aa  677    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  59.59 
 
 		 594 aa  678    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  58.23 
 
 		 617 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  56.52 
 
 		 597 aa  618  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  54.14 
 
 		 593 aa  617  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  60.28 
 
 		 613 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  53.53 
 
 		 598 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  58.18 
 
 		 608 aa  596  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  55.4 
 
 		 597 aa  594  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  52.52 
 
 		 951 aa  587  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  53.09 
 
 		 604 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  55.97 
 
 		 608 aa  572  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  58.29 
 
 		 586 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  53.47 
 
 		 588 aa  566  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  49.65 
 
 		 599 aa  557  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  52.28 
 
 		 630 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  49.83 
 
 		 589 aa  541  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  52.72 
 
 		 595 aa  538  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  49.49 
 
 		 583 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  50 
 
 		 589 aa  528  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  51.46 
 
 		 631 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  50.53 
 
 		 954 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  50.18 
 
 		 590 aa  507  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  50.69 
 
 		 604 aa  503  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  51.79 
 
 		 625 aa  499  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  45.83 
 
 		 596 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  36.59 
 
 		 614 aa  320  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  34.97 
 
 		 663 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  37.82 
 
 		 608 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  35.7 
 
 		 599 aa  290  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  36.74 
 
 		 593 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  34.3 
 
 		 648 aa  280  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  36.03 
 
 		 593 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  34.41 
 
 		 643 aa  274  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  36.76 
 
 		 611 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  35.44 
 
 		 606 aa  272  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  34.63 
 
 		 593 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  33.88 
 
 		 616 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  34.98 
 
 		 616 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  34.66 
 
 		 612 aa  266  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  35.4 
 
 		 610 aa  265  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  33.22 
 
 		 582 aa  263  8e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  35.31 
 
 		 611 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5601  ABC transporter related protein  34.68 
 
 		 563 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.41 
 
 		 256 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  32.13 
 
 		 632 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  31.28 
 
 		 565 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 256 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  32.84 
 
 		 624 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  35.49 
 
 		 832 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  48.59 
 
 		 257 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  48.59 
 
 		 257 aa  237  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  31.4 
 
 		 603 aa  236  6e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  34.78 
 
 		 823 aa  236  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  34.96 
 
 		 823 aa  236  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2146  ABC transporter related  32.88 
 
 		 606 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  49.19 
 
 		 256 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  51.19 
 
 		 252 aa  233  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  33.28 
 
 		 660 aa  233  9e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  33.39 
 
 		 830 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  34.08 
 
 		 679 aa  230  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  31.79 
 
 		 625 aa  229  8e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  49.79 
 
 		 255 aa  229  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  33.76 
 
 		 678 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  33.23 
 
 		 682 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  47.81 
 
 		 253 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  50 
 
 		 255 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  45.97 
 
 		 256 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  37.41 
 
 		 827 aa  227  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  47.83 
 
 		 256 aa  225  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  44.76 
 
 		 250 aa  223  9e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  32.11 
 
 		 603 aa  223  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  32.99 
 
 		 597 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  46.99 
 
 		 261 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.24 
 
 		 609 aa  221  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>