More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2551 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  100 
 
 
256 aa  521  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  67.73 
 
 
258 aa  349  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  67.33 
 
 
258 aa  347  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  67.73 
 
 
258 aa  345  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  67.73 
 
 
258 aa  345  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.93 
 
 
257 aa  341  5.999999999999999e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.13 
 
 
258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  68.13 
 
 
257 aa  335  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  65.99 
 
 
258 aa  334  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  65.59 
 
 
258 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  65.59 
 
 
258 aa  334  9e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  65.59 
 
 
258 aa  334  9e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  65.59 
 
 
258 aa  334  9e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  65.59 
 
 
258 aa  333  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  65.59 
 
 
258 aa  331  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  64.52 
 
 
260 aa  331  8e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  63.31 
 
 
257 aa  329  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  63.71 
 
 
260 aa  329  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  63.71 
 
 
260 aa  329  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  64.52 
 
 
258 aa  328  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  63.71 
 
 
255 aa  327  9e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  64.92 
 
 
256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  64.92 
 
 
264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  62.9 
 
 
257 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  64.52 
 
 
255 aa  325  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  64.8 
 
 
264 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  65.59 
 
 
257 aa  322  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  65.59 
 
 
258 aa  322  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  65.59 
 
 
258 aa  322  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  65.18 
 
 
257 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.18 
 
 
257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.18 
 
 
257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  65.18 
 
 
257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  64.78 
 
 
257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.18 
 
 
257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.18 
 
 
257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.18 
 
 
257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.18 
 
 
257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6414  ABC transporter related  65.59 
 
 
258 aa  319  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476451  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  59.29 
 
 
257 aa  305  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  56.52 
 
 
334 aa  279  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  56.52 
 
 
333 aa  276  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  58.06 
 
 
253 aa  274  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  56.47 
 
 
293 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  55.56 
 
 
275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  55.56 
 
 
275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  55.56 
 
 
275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  55.16 
 
 
283 aa  271  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  53.52 
 
 
276 aa  270  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  53.73 
 
 
271 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  54.18 
 
 
256 aa  267  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1445  ABC transporter related  67 
 
 
216 aa  263  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  51.97 
 
 
258 aa  262  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  54.4 
 
 
261 aa  261  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  52.94 
 
 
255 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  53.41 
 
 
259 aa  259  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  53.73 
 
 
261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  52.17 
 
 
270 aa  258  7e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  50.58 
 
 
261 aa  257  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  48.61 
 
 
307 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  48.26 
 
 
302 aa  256  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  50.79 
 
 
255 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  47.58 
 
 
251 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  50.59 
 
 
255 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  53.75 
 
 
271 aa  255  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  53.63 
 
 
256 aa  254  7e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  50.4 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  53.57 
 
 
294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  50.79 
 
 
265 aa  251  8.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  51.21 
 
 
255 aa  251  8.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  50 
 
 
257 aa  250  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  50.2 
 
 
261 aa  250  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  48.21 
 
 
265 aa  250  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.59 
 
 
256 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  50 
 
 
259 aa  249  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  51.75 
 
 
262 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  50.99 
 
 
280 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
257 aa  249  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  49.6 
 
 
264 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 
256 aa  248  9e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  48.39 
 
 
250 aa  246  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  49.4 
 
 
255 aa  246  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  51.2 
 
 
263 aa  246  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  48.29 
 
 
262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  47.41 
 
 
284 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  50.79 
 
 
257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49 
 
 
256 aa  245  6e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  51.57 
 
 
270 aa  245  6e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 
254 aa  244  6.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.59 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  50.4 
 
 
265 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  50.4 
 
 
265 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  48.79 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  52.94 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  47.04 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  50.4 
 
 
255 aa  243  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  47.18 
 
 
250 aa  242  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2110  ABC transporter related  50.2 
 
 
254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  50.2 
 
 
277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>