More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0268 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  100 
 
 
265 aa  540  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  59.78 
 
 
284 aa  317  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  59.78 
 
 
284 aa  316  3e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  57.09 
 
 
259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  57.2 
 
 
288 aa  305  3e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  58.04 
 
 
255 aa  295  5e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  56.45 
 
 
271 aa  289  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  55.38 
 
 
257 aa  288  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  51.94 
 
 
261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  52.11 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  54.12 
 
 
259 aa  281  9e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  52.71 
 
 
262 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  56.86 
 
 
260 aa  279  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  53.88 
 
 
263 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  53.52 
 
 
259 aa  276  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  54.37 
 
 
256 aa  275  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  54.09 
 
 
256 aa  275  7e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  50.38 
 
 
261 aa  274  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  54.72 
 
 
286 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  52.38 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  50 
 
 
262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  52.19 
 
 
255 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  52.55 
 
 
258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  52.94 
 
 
264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  51.97 
 
 
255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0565  ABC transporter related  50.59 
 
 
255 aa  271  7e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0274891  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  52.96 
 
 
255 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  52.55 
 
 
265 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  54.76 
 
 
252 aa  270  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.31 
 
 
254 aa  270  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  51.54 
 
 
261 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2110  ABC transporter related  56.18 
 
 
254 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2499  ABC transporter related  55.91 
 
 
264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.513432  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  50 
 
 
270 aa  268  8e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  52.96 
 
 
258 aa  268  8.999999999999999e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  54.12 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  51.76 
 
 
276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  54.15 
 
 
254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  51.57 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  50.98 
 
 
270 aa  266  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  51.57 
 
 
255 aa  265  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  50.98 
 
 
258 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 
256 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  50.94 
 
 
277 aa  264  8.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  46.64 
 
 
302 aa  264  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  48.83 
 
 
256 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  51.18 
 
 
257 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  49.41 
 
 
255 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.15 
 
 
258 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  52.16 
 
 
258 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  50 
 
 
260 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  50.59 
 
 
260 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  50.59 
 
 
260 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.15 
 
 
256 aa  262  4e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
255 aa  262  4e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  51.79 
 
 
270 aa  262  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  50.2 
 
 
259 aa  262  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  51.79 
 
 
270 aa  261  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0519  ABC transporter related  49.8 
 
 
255 aa  261  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  53.52 
 
 
257 aa  261  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  50.4 
 
 
257 aa  260  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  49.8 
 
 
252 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  50.79 
 
 
333 aa  260  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  51.6 
 
 
256 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  50.2 
 
 
271 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  50.98 
 
 
258 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.76 
 
 
258 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  50.98 
 
 
258 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4056  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
256 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  52.02 
 
 
270 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  52.17 
 
 
281 aa  259  3e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  51.37 
 
 
258 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  51.37 
 
 
258 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0107  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.21 
 
 
256 aa  259  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  51.37 
 
 
258 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  53.57 
 
 
252 aa  259  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  50.19 
 
 
264 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  47.65 
 
 
307 aa  258  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  48.84 
 
 
261 aa  258  8e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.98 
 
 
257 aa  258  9e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03304  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  49.02 
 
 
255 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0260  ABC transporter related protein  49.02 
 
 
255 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0261  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.02 
 
 
255 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03257  hypothetical protein  49.02 
 
 
255 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4772  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.02 
 
 
255 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3867  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.02 
 
 
255 aa  258  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  51.78 
 
 
263 aa  257  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3653  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.02 
 
 
255 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3737  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.02 
 
 
255 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0101  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.81 
 
 
256 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3934  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.02 
 
 
255 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  50 
 
 
258 aa  256  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  52.99 
 
 
271 aa  256  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  52.92 
 
 
257 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3932  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.24 
 
 
255 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0231  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.6 
 
 
255 aa  255  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  50.99 
 
 
271 aa  255  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  52.59 
 
 
271 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3869  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.21 
 
 
256 aa  255  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3763  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.24 
 
 
255 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>