More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0565 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0565  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0274891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  83.92 
 
 		 255 aa  447  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0519  ABC transporter related  70.59 
 
 		 255 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2117  ABC transporter related  66.14 
 
 		 251 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  62.45 
 
 		 258 aa  329  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  54.9 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  54.33 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  51.97 
 
 		 259 aa  274  8e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  50.79 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  53.41 
 
 		 271 aa  272  5.000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  50.59 
 
 		 265 aa  271  6e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  50.4 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  53.17 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.17 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  53.01 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  51.79 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  52.78 
 
 		 252 aa  268  5e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  50 
 
 		 256 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  52.78 
 
 		 270 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.39 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  50 
 
 		 259 aa  265  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2499  ABC transporter related  55.51 
 
 		 264 aa  265  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.513432  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  51.39 
 
 		 257 aa  265  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  50.4 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  50.6 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  51 
 
 		 263 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  49.01 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  48.33 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  49.6 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  48.71 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  49.8 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  51.78 
 
 		 263 aa  255  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  48.51 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  50.2 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  48.83 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  47.04 
 
 		 254 aa  251  8.000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  51 
 
 		 286 aa  251  9.000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  49.6 
 
 		 273 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  48.83 
 
 		 261 aa  248  9e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  48.19 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  45.95 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.19 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  47.79 
 
 		 270 aa  246  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  48.81 
 
 		 258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  48.81 
 
 		 258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  47.79 
 
 		 258 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 256 aa  245  6e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  46.88 
 
 		 262 aa  244  8e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 255 aa  244  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.2 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  48.19 
 
 		 257 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.8 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.8 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  47.79 
 
 		 257 aa  241  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  49 
 
 		 258 aa  241  9e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  48.79 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  48.79 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  48.39 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  48.79 
 
 		 257 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  48.61 
 
 		 264 aa  239  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  48.39 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  48.39 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.6 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.02 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.6 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  45.14 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  47.22 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.6 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  45.82 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.2 
 
 		 255 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  46.61 
 
 		 256 aa  238  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  47.01 
 
 		 259 aa  238  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  46.22 
 
 		 257 aa  238  6.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  48.62 
 
 		 260 aa  238  8e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  47.39 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  47.98 
 
 		 258 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  47.39 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.98 
 
 		 257 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.39 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.39 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.39 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  48.39 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.6 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 256 aa  237  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.39 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0684  ABC transporter related protein  48.61 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.003005  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.6 
 
 		 254 aa  237  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.39 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  47.81 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.22 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  47.81 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  47.58 
 
 		 258 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  47.18 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  46.83 
 
 		 257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  47.43 
 
 		 273 aa  235  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  46.61 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>