More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0402 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
254 aa  510  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.24 
 
 
256 aa  359  2e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.43 
 
 
256 aa  358  4e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  69.84 
 
 
256 aa  358  5e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.24 
 
 
256 aa  358  5e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  66.27 
 
 
255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  58 
 
 
259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  52 
 
 
252 aa  270  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.61 
 
 
258 aa  262  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  51.61 
 
 
258 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  52.21 
 
 
259 aa  259  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  50.81 
 
 
258 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  50.81 
 
 
258 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  50.81 
 
 
258 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  50.8 
 
 
252 aa  259  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  51.41 
 
 
257 aa  258  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  50.59 
 
 
261 aa  258  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  46.52 
 
 
284 aa  256  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  50.81 
 
 
258 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  51.61 
 
 
256 aa  255  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  51 
 
 
257 aa  255  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  50 
 
 
260 aa  255  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.19 
 
 
254 aa  254  7e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  46.15 
 
 
284 aa  254  7e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  50 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  50.2 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  50.81 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  51 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  50.2 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  47.45 
 
 
288 aa  253  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  50.6 
 
 
257 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  47.6 
 
 
258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  50 
 
 
260 aa  251  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  50 
 
 
260 aa  251  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  50.2 
 
 
258 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  50.79 
 
 
265 aa  250  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  51.21 
 
 
257 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.21 
 
 
257 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.61 
 
 
257 aa  250  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.21 
 
 
257 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.21 
 
 
257 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.21 
 
 
257 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  51.61 
 
 
258 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  51.61 
 
 
258 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.21 
 
 
257 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  49 
 
 
258 aa  249  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  48.19 
 
 
263 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  50.8 
 
 
255 aa  250  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  48.8 
 
 
252 aa  249  3e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  49.2 
 
 
271 aa  249  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  51.61 
 
 
257 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  49.41 
 
 
270 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  49.41 
 
 
270 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  49.8 
 
 
256 aa  248  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  47.83 
 
 
271 aa  248  6e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 
258 aa  248  9e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  49.6 
 
 
258 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.2 
 
 
256 aa  247  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  49.6 
 
 
258 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  48.02 
 
 
254 aa  247  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  50.6 
 
 
258 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  49.4 
 
 
276 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  49.41 
 
 
270 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 
257 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  49.2 
 
 
253 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  46.59 
 
 
270 aa  245  4e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  50.2 
 
 
256 aa  244  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  50.2 
 
 
258 aa  244  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  47.79 
 
 
256 aa  244  9e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  49.4 
 
 
261 aa  242  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  48.22 
 
 
255 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  48.24 
 
 
262 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.4 
 
 
257 aa  242  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  45.02 
 
 
256 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  48 
 
 
293 aa  242  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  46.18 
 
 
264 aa  241  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  47.39 
 
 
271 aa  241  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  50.2 
 
 
255 aa  241  7e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  47.2 
 
 
259 aa  241  9e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  47.6 
 
 
283 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  50.4 
 
 
257 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  52.21 
 
 
261 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  48.21 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  47.79 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  48.19 
 
 
268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  50 
 
 
263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  45.88 
 
 
270 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  47.79 
 
 
256 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  47.06 
 
 
262 aa  238  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  47.24 
 
 
261 aa  238  5e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  49.4 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  46.99 
 
 
275 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  46.99 
 
 
275 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  46.99 
 
 
275 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  43.55 
 
 
307 aa  238  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  48 
 
 
259 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  46.59 
 
 
261 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  46.18 
 
 
265 aa  237  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  47.2 
 
 
264 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2110  ABC transporter related  49.8 
 
 
254 aa  237  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>