More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0401 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 
254 aa  509  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  78.66 
 
 
254 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  63.64 
 
 
261 aa  320  9.999999999999999e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  59.45 
 
 
255 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  59.45 
 
 
255 aa  311  6.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  60.56 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  59.36 
 
 
252 aa  299  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  57.77 
 
 
252 aa  297  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  56.97 
 
 
264 aa  296  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  58.17 
 
 
286 aa  294  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  57.09 
 
 
268 aa  292  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  57.37 
 
 
252 aa  291  6e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  55.38 
 
 
265 aa  289  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  55.95 
 
 
256 aa  286  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  54.15 
 
 
281 aa  285  5.999999999999999e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  53.82 
 
 
256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  54.05 
 
 
261 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  53.54 
 
 
255 aa  278  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  52.96 
 
 
284 aa  276  3e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  53.2 
 
 
273 aa  275  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  53.36 
 
 
271 aa  275  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  54.15 
 
 
255 aa  274  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  52.99 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  53.75 
 
 
255 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  52.22 
 
 
284 aa  272  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  51.17 
 
 
262 aa  272  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2499  ABC transporter related  56.92 
 
 
264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.513432  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  51.59 
 
 
255 aa  271  6e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  51.81 
 
 
270 aa  271  8.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  51.36 
 
 
270 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  54.98 
 
 
280 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  51.97 
 
 
261 aa  269  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  52.8 
 
 
271 aa  269  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  53.01 
 
 
333 aa  268  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  52.38 
 
 
271 aa  268  5.9999999999999995e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  54.18 
 
 
259 aa  266  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  56.28 
 
 
271 aa  266  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  53.78 
 
 
264 aa  266  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  51.79 
 
 
270 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.41 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  53.01 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  54.15 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  53.01 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.41 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4334  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.41 
 
 
255 aa  265  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231493  normal  0.133886 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  51.79 
 
 
270 aa  265  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  52.17 
 
 
255 aa  265  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  52.14 
 
 
262 aa  265  5e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  51 
 
 
256 aa  265  7e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  51.98 
 
 
257 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  51.79 
 
 
270 aa  263  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  52.42 
 
 
271 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  55.38 
 
 
255 aa  263  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  48.26 
 
 
302 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  53.17 
 
 
260 aa  262  4e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  51.19 
 
 
257 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  51.41 
 
 
258 aa  261  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  52.21 
 
 
334 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  52.21 
 
 
283 aa  260  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  53.01 
 
 
275 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  53.41 
 
 
294 aa  259  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  53.01 
 
 
275 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  50.2 
 
 
256 aa  259  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  53.01 
 
 
275 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  52.21 
 
 
293 aa  259  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  50.55 
 
 
288 aa  259  4e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  50.79 
 
 
276 aa  259  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  48.26 
 
 
307 aa  258  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  50 
 
 
263 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.2 
 
 
251 aa  258  9e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  48.03 
 
 
253 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.2 
 
 
255 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  53.01 
 
 
265 aa  254  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  53.01 
 
 
265 aa  254  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  51.19 
 
 
258 aa  254  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  50.2 
 
 
258 aa  254  8e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 
255 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  51.39 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  48.59 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.21 
 
 
258 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.2 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.2 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  50.59 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  51 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  49.8 
 
 
273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  50.2 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.41 
 
 
256 aa  253  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.2 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.41 
 
 
255 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3752  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.41 
 
 
255 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  48.21 
 
 
256 aa  251  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3763  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.41 
 
 
255 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3830  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.41 
 
 
255 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  51 
 
 
256 aa  252  5.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.2 
 
 
255 aa  251  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0231  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51 
 
 
255 aa  251  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  50.81 
 
 
258 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2110  ABC transporter related  53.78 
 
 
254 aa  251  8.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  51 
 
 
250 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0565  ABC transporter related  47.04 
 
 
255 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0274891  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>