More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3794 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  91.76 
 
 		 255 aa  481  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  89.8 
 
 		 258 aa  471  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  89.72 
 
 		 260 aa  470  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  89.15 
 
 		 260 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  89.06 
 
 		 256 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  89.15 
 
 		 260 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  86.96 
 
 		 257 aa  451  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  84.31 
 
 		 258 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  85.77 
 
 		 264 aa  447  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  86.17 
 
 		 257 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  86.56 
 
 		 264 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  75.78 
 
 		 258 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  76.31 
 
 		 258 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  74.5 
 
 		 258 aa  394  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  76.31 
 
 		 258 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  76.31 
 
 		 258 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.1 
 
 		 257 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  75.9 
 
 		 258 aa  391  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  74.1 
 
 		 258 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  75.9 
 
 		 258 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  76.86 
 
 		 257 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  76.86 
 
 		 257 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  76.86 
 
 		 257 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  76.86 
 
 		 257 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  76.86 
 
 		 257 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  76.86 
 
 		 257 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  76.86 
 
 		 257 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  73.83 
 
 		 258 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  75.29 
 
 		 257 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  73.31 
 
 		 258 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  75.69 
 
 		 257 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  73.31 
 
 		 258 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  75.9 
 
 		 257 aa  380  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  75.9 
 
 		 258 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  75.9 
 
 		 258 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6414  ABC transporter related  74.7 
 
 		 258 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  65.08 
 
 		 253 aa  335  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  68 
 
 		 257 aa  334  9e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  64.54 
 
 		 257 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  63.71 
 
 		 256 aa  327  9e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  57.77 
 
 		 271 aa  288  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  54.76 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  54.62 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  55.2 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  55.2 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  55.2 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  55.56 
 
 		 258 aa  278  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 276 aa  278  8e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  54 
 
 		 283 aa  277  9e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  54.4 
 
 		 293 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1445  ABC transporter related  68.32 
 
 		 216 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  52.38 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  54.98 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  54.72 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  51.97 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  54.76 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  54.76 
 
 		 261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  52.96 
 
 		 259 aa  268  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  53.15 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  52.38 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  52.61 
 
 		 271 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  54.66 
 
 		 271 aa  267  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  52.36 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  51.98 
 
 		 255 aa  265  7e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  50.81 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  50.39 
 
 		 270 aa  261  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  51.37 
 
 		 262 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  51.18 
 
 		 262 aa  261  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  48.78 
 
 		 307 aa  261  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  53.23 
 
 		 294 aa  259  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  51.39 
 
 		 265 aa  259  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  51.2 
 
 		 255 aa  258  6e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  52.4 
 
 		 255 aa  258  8e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  49.6 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  54.4 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  51 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  49.61 
 
 		 261 aa  255  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  48.95 
 
 		 302 aa  255  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.62 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  49.8 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  53.75 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  51 
 
 		 280 aa  252  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.62 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.8 
 
 		 256 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.19 
 
 		 261 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  48.44 
 
 		 263 aa  252  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.22 
 
 		 255 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2110  ABC transporter related  49.8 
 
 		 254 aa  251  6e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 268 aa  251  9.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.83 
 
 		 255 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.83 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  46.8 
 
 		 250 aa  250  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  50.8 
 
 		 271 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5271  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.19 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5016  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.19 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.836649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  49.6 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  51.75 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>