More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2394 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  100 
 
 		 262 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  83.01 
 
 		 270 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  72.52 
 
 		 262 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  72.59 
 
 		 261 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  71.15 
 
 		 261 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  55.04 
 
 		 271 aa  293  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  54.26 
 
 		 256 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  53.67 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  53.28 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 276 aa  277  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  52.87 
 
 		 270 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  53.67 
 
 		 259 aa  275  7e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.49 
 
 		 270 aa  274  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.97 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  52.51 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  50 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  51.92 
 
 		 257 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  51.17 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  53.49 
 
 		 258 aa  271  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  53.49 
 
 		 258 aa  271  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  52.49 
 
 		 270 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  51.55 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  51.54 
 
 		 257 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  52.49 
 
 		 271 aa  268  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  52.73 
 
 		 259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  52.33 
 
 		 258 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  52.71 
 
 		 258 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  52.34 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.71 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.46 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  56.47 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  53.15 
 
 		 270 aa  266  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  53.85 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  53.82 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  52.31 
 
 		 260 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  51.76 
 
 		 256 aa  265  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 271 aa  265  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  54.51 
 
 		 268 aa  265  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  52.73 
 
 		 253 aa  265  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  51.92 
 
 		 258 aa  265  8e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  49.42 
 
 		 255 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  55.89 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  53.08 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  53.08 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  53.08 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  50.78 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  51.95 
 
 		 259 aa  263  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  52.14 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  52.92 
 
 		 258 aa  262  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  52.92 
 
 		 258 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 		 258 aa  262  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  52.12 
 
 		 256 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  51.37 
 
 		 255 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  51.92 
 
 		 260 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  51.92 
 
 		 260 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  54.12 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  52.51 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  49.03 
 
 		 261 aa  259  2e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  50.57 
 
 		 271 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0519  ABC transporter related  48.64 
 
 		 255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  49.01 
 
 		 256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  50.58 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  50.78 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  52.14 
 
 		 257 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  51.75 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.03 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  52.87 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  51.53 
 
 		 257 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  51.16 
 
 		 277 aa  256  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  50.39 
 
 		 256 aa  255  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  51.17 
 
 		 259 aa  255  5e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  51.75 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  48.05 
 
 		 252 aa  255  6e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  49.47 
 
 		 288 aa  254  9e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  53.12 
 
 		 283 aa  254  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  49.44 
 
 		 284 aa  254  9e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  49.44 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  50 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  52.73 
 
 		 293 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.75 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  53.46 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  52.71 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  51.57 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  53.46 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.46 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  53.46 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.46 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.46 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.46 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.46 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.46 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0489  ABC transporter related  45.1 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0363461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  53.7 
 
 		 257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  52.73 
 
 		 275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  52.73 
 
 		 275 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  52.73 
 
 		 275 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  49.42 
 
 		 255 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3737  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.86 
 
 		 255 aa  251  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  48.85 
 
 		 286 aa  251  7e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0261  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.86 
 
 		 255 aa  251  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>