More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2653 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 268 aa  544  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  77.82 
 
 		 271 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  62.45 
 
 		 264 aa  328  7e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  62.6 
 
 		 265 aa  327  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  58.73 
 
 		 270 aa  312  2.9999999999999996e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  59.61 
 
 		 259 aa  310  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  57.26 
 
 		 254 aa  294  1e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  54.94 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  54.73 
 
 		 271 aa  278  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  55.42 
 
 		 255 aa  278  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  55.47 
 
 		 262 aa  278  8e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  55.65 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  51.48 
 
 		 273 aa  276  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  55.73 
 
 		 257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 		 254 aa  272  3e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  55.34 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  53.15 
 
 		 256 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  53.75 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  52.59 
 
 		 271 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.64 
 
 		 256 aa  268  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  54.47 
 
 		 262 aa  267  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  53.75 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  54.72 
 
 		 270 aa  267  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  52.36 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  52.16 
 
 		 276 aa  267  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.39 
 
 		 255 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.39 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  56.05 
 
 		 280 aa  266  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  53.7 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  53.63 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  54.58 
 
 		 293 aa  266  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  54.18 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  52.96 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  52.96 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  52.96 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  52.42 
 
 		 259 aa  266  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  50.99 
 
 		 259 aa  265  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  51.91 
 
 		 257 aa  265  5.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 		 255 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  56.25 
 
 		 260 aa  265  7e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.12 
 
 		 258 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  52.96 
 
 		 256 aa  264  8.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  55.34 
 
 		 261 aa  264  8.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.39 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  53.41 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  48.81 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  52.34 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  52.76 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  51.76 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.97 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  50.2 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  54.62 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.57 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  52.57 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  49.6 
 
 		 263 aa  261  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.18 
 
 		 255 aa  261  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  53.78 
 
 		 275 aa  261  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  53.78 
 
 		 275 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  53.78 
 
 		 275 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  51.76 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  50.39 
 
 		 256 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  50.2 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  50.4 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  52.34 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  55.02 
 
 		 294 aa  258  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19620  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.39 
 
 		 255 aa  258  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.76 
 
 		 258 aa  258  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  50.18 
 
 		 288 aa  258  7e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4334  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 255 aa  258  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231493  normal  0.133886 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  53.52 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  49.8 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  52.82 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.81 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.188258 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  52.02 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  51.55 
 
 		 258 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  53.52 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  51.37 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  53.12 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  52.17 
 
 		 334 aa  256  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  51.61 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.12 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.12 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.12 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.12 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.12 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.12 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  50 
 
 		 284 aa  256  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  50.38 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  53.52 
 
 		 257 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  49.41 
 
 		 257 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.39 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  49.41 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  51.61 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  50.97 
 
 		 265 aa  254  7e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  46.9 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  50.2 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  50.4 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>