More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0638 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  70.31 
 
 
259 aa  370  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  63.39 
 
 
273 aa  330  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  58.43 
 
 
264 aa  298  5e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  59.52 
 
 
263 aa  297  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  58.43 
 
 
265 aa  297  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  56.97 
 
 
259 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  56.73 
 
 
288 aa  293  1e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  55.68 
 
 
284 aa  289  3e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  56.92 
 
 
270 aa  288  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  56.92 
 
 
270 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  55.68 
 
 
284 aa  288  7e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  56.86 
 
 
265 aa  287  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  57.54 
 
 
271 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  56.52 
 
 
270 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  58.33 
 
 
276 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  57.65 
 
 
257 aa  284  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  56.03 
 
 
262 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  57.2 
 
 
271 aa  280  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  58.17 
 
 
261 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  55.86 
 
 
259 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  55.34 
 
 
270 aa  280  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  55.34 
 
 
258 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  59.92 
 
 
271 aa  279  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  55.91 
 
 
255 aa  278  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  56.52 
 
 
257 aa  276  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
255 aa  275  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  55.89 
 
 
262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  51.56 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  54.98 
 
 
334 aa  272  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  56.45 
 
 
271 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  53.17 
 
 
254 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  56.13 
 
 
257 aa  271  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  53.31 
 
 
261 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  56.35 
 
 
268 aa  270  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.12 
 
 
256 aa  268  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  55.38 
 
 
333 aa  268  8e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  52.76 
 
 
261 aa  265  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  55.24 
 
 
258 aa  265  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  53.78 
 
 
275 aa  264  8e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  53.78 
 
 
275 aa  264  8e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  53.78 
 
 
275 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  54.09 
 
 
270 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  53.36 
 
 
256 aa  263  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  52.53 
 
 
256 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.39 
 
 
254 aa  263  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  55.29 
 
 
261 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  52.19 
 
 
255 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.57 
 
 
255 aa  261  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  52.19 
 
 
252 aa  261  6e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  54.18 
 
 
283 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  54.44 
 
 
258 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  54.44 
 
 
258 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  54.44 
 
 
258 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  54.44 
 
 
258 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.39 
 
 
261 aa  260  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.02 
 
 
256 aa  260  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  56.8 
 
 
294 aa  259  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  50.4 
 
 
255 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  52.99 
 
 
281 aa  259  2e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  53.73 
 
 
263 aa  259  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.39 
 
 
255 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  54.18 
 
 
293 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  55.38 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
255 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  51.56 
 
 
286 aa  258  8e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
255 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 
255 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  51.59 
 
 
259 aa  257  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  50.98 
 
 
256 aa  257  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  53.63 
 
 
258 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  50.8 
 
 
252 aa  257  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  48.28 
 
 
307 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.39 
 
 
255 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  50.76 
 
 
277 aa  256  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  51.98 
 
 
255 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
255 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  51.79 
 
 
255 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
255 aa  255  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.2 
 
 
257 aa  255  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4429  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 
257 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0654  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 
257 aa  254  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  52.59 
 
 
264 aa  254  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  53.63 
 
 
258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.02 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  54.15 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  47.67 
 
 
261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  53.23 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  48.28 
 
 
302 aa  253  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
263 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.188258 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  49.8 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  50 
 
 
255 aa  252  5.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5271  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.4 
 
 
257 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878512  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  48.21 
 
 
252 aa  251  7e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3351  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.4 
 
 
257 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5016  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.4 
 
 
257 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.836649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  52.36 
 
 
255 aa  250  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 
255 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  51.79 
 
 
259 aa  250  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>