More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0536 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  100 
 
 		 281 aa  577  1e-164  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  60.85 
 
 		 264 aa  333  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  59.76 
 
 		 286 aa  308  5e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  57.54 
 
 		 252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  55.56 
 
 		 252 aa  296  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  54.76 
 
 		 259 aa  291  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  50.9 
 
 		 284 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  54.15 
 
 		 254 aa  285  7e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  53.82 
 
 		 263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  50.54 
 
 		 284 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  52.38 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  50.92 
 
 		 288 aa  277  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  50.99 
 
 		 255 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  52.38 
 
 		 264 aa  275  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  51.18 
 
 		 259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  51.36 
 
 		 261 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  50.4 
 
 		 256 aa  269  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  51.38 
 
 		 255 aa  265  5.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  52.38 
 
 		 276 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  52.16 
 
 		 258 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  49.4 
 
 		 252 aa  261  1e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  50.4 
 
 		 270 aa  260  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  52.17 
 
 		 265 aa  259  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  51.79 
 
 		 271 aa  259  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  50.2 
 
 		 263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 271 aa  258  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  48.84 
 
 		 261 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  52.4 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  50.81 
 
 		 257 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  50.81 
 
 		 271 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  52.61 
 
 		 261 aa  255  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  50.99 
 
 		 280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  51.59 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  48.4 
 
 		 255 aa  253  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  49.03 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  48.46 
 
 		 261 aa  251  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 260 aa  251  7e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0231  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  49.21 
 
 		 259 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  48.63 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  49.6 
 
 		 273 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  49.41 
 
 		 259 aa  249  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  49.6 
 
 		 259 aa  246  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0107  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.45 
 
 		 256 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2499  ABC transporter related  52.17 
 
 		 264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.513432  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0101  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.41 
 
 		 256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03304  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  48.21 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0260  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0261  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.6 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0519  ABC transporter related  46.27 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03257  hypothetical protein  48.21 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3867  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3934  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3653  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.6 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4772  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3737  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3858  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.199683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.2 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.6 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 255 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.22 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  46.5 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.22 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.22 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.6 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  49.81 
 
 		 294 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3869  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.41 
 
 		 256 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3932  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.61 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  47.41 
 
 		 250 aa  242  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  52.72 
 
 		 258 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  50.42 
 
 		 268 aa  242  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4056  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.41 
 
 		 256 aa  242  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  45.1 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  46.77 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3763  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  47.01 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.77 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  46.48 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3752  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  48.35 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3830  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  48.76 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.6 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.63 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  46.01 
 
 		 277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  46.69 
 
 		 334 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  51.05 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  50.63 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.6 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  48.21 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  50.63 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  50.63 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19620  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.02 
 
 		 255 aa  239  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00232655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  47.04 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  49 
 
 		 275 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  49 
 
 		 275 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>