More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0357 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  527  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.37 
 
 		 256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  54.58 
 
 		 257 aa  275  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  54.58 
 
 		 264 aa  275  7e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  53.39 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  50.4 
 
 		 252 aa  269  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  53.52 
 
 		 273 aa  267  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  54.15 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  50.98 
 
 		 263 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  51.78 
 
 		 271 aa  264  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  54.69 
 
 		 255 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  51.59 
 
 		 273 aa  260  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  49.31 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  53.15 
 
 		 255 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  49.2 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  50.79 
 
 		 259 aa  259  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  51.38 
 
 		 275 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  51.38 
 
 		 275 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  51.38 
 
 		 275 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  51.59 
 
 		 276 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  51.18 
 
 		 265 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  51.97 
 
 		 256 aa  255  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  47.49 
 
 		 262 aa  255  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  48.22 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  50.39 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  52.76 
 
 		 260 aa  252  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  51.78 
 
 		 255 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  50.99 
 
 		 283 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  51.18 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  49.01 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  50.2 
 
 		 256 aa  250  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  49 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  50.99 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  50.2 
 
 		 271 aa  249  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  48.8 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  50.39 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  47.51 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  47.64 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.4 
 
 		 255 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  46.88 
 
 		 302 aa  248  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  48.39 
 
 		 260 aa  248  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  48.39 
 
 		 260 aa  248  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  46.89 
 
 		 284 aa  248  8e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  50 
 
 		 255 aa  248  8e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.4 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.4 
 
 		 255 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  50.79 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  50 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  50 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.4 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  47.81 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3819  ABC transporter related  46.85 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0171499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  49.2 
 
 		 256 aa  247  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  49.6 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  46.89 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  51.18 
 
 		 257 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  51.19 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  48.61 
 
 		 257 aa  245  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  50.2 
 
 		 263 aa  245  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  46.15 
 
 		 262 aa  245  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  48.43 
 
 		 258 aa  245  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.62 
 
 		 263 aa  244  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.188258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  47.58 
 
 		 257 aa  244  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  47.6 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  50.4 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  49 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  45.45 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  49.61 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  47.98 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  47.6 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  48.02 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  48 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  47.6 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0566  ABC transporter related  49.25 
 
 		 277 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  47.58 
 
 		 257 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  49 
 
 		 256 aa  243  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  48.39 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  46.69 
 
 		 270 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  46.77 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  46.15 
 
 		 261 aa  242  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  48.64 
 
 		 270 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  47.81 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  47.24 
 
 		 271 aa  242  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 261 aa  241  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.64 
 
 		 270 aa  242  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0356  ABC transporter related  50 
 
 		 290 aa  241  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  44.58 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  50.2 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  45.38 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  49.4 
 
 		 259 aa  239  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  49.4 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  48.25 
 
 		 270 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  45.49 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  46.77 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>