More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3796 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  540  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  540  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_003296  RS01988  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  96.36 
 
 		 265 aa  441  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.302252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  56.35 
 
 		 334 aa  284  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  55.56 
 
 		 271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  54 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  56.85 
 
 		 261 aa  280  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  54.76 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  55.34 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  53.54 
 
 		 258 aa  278  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  55.34 
 
 		 293 aa  278  8e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  53.57 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  53.85 
 
 		 258 aa  275  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  55.47 
 
 		 275 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  55.47 
 
 		 275 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  53.04 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  53.04 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  55.51 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  53.04 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  53.44 
 
 		 258 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 256 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  54.47 
 
 		 294 aa  271  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  52.42 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.04 
 
 		 258 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  51 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  52.63 
 
 		 258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  51.59 
 
 		 255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  52.38 
 
 		 265 aa  268  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  53.17 
 
 		 276 aa  268  8e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  53.01 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  52.4 
 
 		 257 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  53.69 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  51.76 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  52 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  52.21 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  51.79 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  50.2 
 
 		 256 aa  262  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  52.17 
 
 		 280 aa  262  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  52.42 
 
 		 258 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  50.6 
 
 		 259 aa  260  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  52.61 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.44 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  52.02 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  53.44 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.44 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.44 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.42 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.44 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.44 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.44 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  49.8 
 
 		 255 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  52.42 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  52.42 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  53.04 
 
 		 258 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  53.04 
 
 		 258 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  51.01 
 
 		 268 aa  258  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  53.04 
 
 		 257 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  52.8 
 
 		 271 aa  258  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  52.23 
 
 		 257 aa  258  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  50.81 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  46.21 
 
 		 302 aa  257  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  50.81 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  51.61 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  49.21 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  52.02 
 
 		 257 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  51.79 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  51.61 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  51.79 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  50 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  46.55 
 
 		 307 aa  255  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  51.79 
 
 		 259 aa  256  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  50 
 
 		 261 aa  255  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  51.21 
 
 		 260 aa  255  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  48.43 
 
 		 256 aa  255  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  51.61 
 
 		 260 aa  254  8e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  50 
 
 		 255 aa  254  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  51.61 
 
 		 260 aa  254  8e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  50 
 
 		 284 aa  254  9e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  49.64 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.82 
 
 		 257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  51.2 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  52.21 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  52 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.41 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  48.81 
 
 		 255 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  52.42 
 
 		 271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  50.4 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  50 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  49.43 
 
 		 286 aa  252  6e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  50.2 
 
 		 255 aa  251  7e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 256 aa  250  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  52.02 
 
 		 270 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  48.4 
 
 		 256 aa  250  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  51.61 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  52.42 
 
 		 264 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  49.6 
 
 		 259 aa  249  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  49.21 
 
 		 273 aa  248  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  48.19 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  48.81 
 
 		 259 aa  248  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>