More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2103 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  522  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  98.83 
 
 		 257 aa  517  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  87.89 
 
 		 260 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  87.84 
 
 		 256 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  87.89 
 
 		 260 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  87.89 
 
 		 260 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  86.17 
 
 		 255 aa  454  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  85.77 
 
 		 258 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  86.96 
 
 		 255 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  85.38 
 
 		 258 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  83.92 
 
 		 264 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  85.55 
 
 		 264 aa  434  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.6 
 
 		 257 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  71.09 
 
 		 258 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  71.09 
 
 		 258 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  71.09 
 
 		 258 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  74.5 
 
 		 258 aa  387  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  70.7 
 
 		 258 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  74.1 
 
 		 258 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  74.1 
 
 		 258 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  74.1 
 
 		 258 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  74.1 
 
 		 258 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  72.91 
 
 		 258 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  72.91 
 
 		 258 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.93 
 
 		 257 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  73.93 
 
 		 257 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.93 
 
 		 257 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.93 
 
 		 257 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.93 
 
 		 257 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.93 
 
 		 257 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.93 
 
 		 257 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  72.37 
 
 		 257 aa  374  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  74.1 
 
 		 258 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  74.1 
 
 		 258 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  72.76 
 
 		 257 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  71.6 
 
 		 257 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6414  ABC transporter related  74.7 
 
 		 258 aa  364  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  64.03 
 
 		 257 aa  332  4e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  63.1 
 
 		 253 aa  328  6e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  62.9 
 
 		 256 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  63.14 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  58.96 
 
 		 271 aa  294  7e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  55.2 
 
 		 275 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  55.2 
 
 		 275 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  55.2 
 
 		 275 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  54.4 
 
 		 293 aa  279  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  54 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  54.47 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  54.22 
 
 		 276 aa  274  9e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  53.01 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  53.6 
 
 		 334 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  52.71 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  54.4 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  51.16 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  54.84 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  51.54 
 
 		 262 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  54.55 
 
 		 261 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  53.78 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  51 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1445  ABC transporter related  66.83 
 
 		 216 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  54.4 
 
 		 333 aa  265  5e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  51.18 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  52.17 
 
 		 259 aa  263  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  51.59 
 
 		 265 aa  262  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  50.39 
 
 		 262 aa  261  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  51.18 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  51.61 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.2 
 
 		 255 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 		 255 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.41 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 		 255 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  52.63 
 
 		 271 aa  258  9e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 		 255 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.41 
 
 		 256 aa  258  9e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  49.8 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  49.6 
 
 		 264 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  48.83 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.61 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  51.95 
 
 		 271 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  48.4 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  51.41 
 
 		 255 aa  254  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  51 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  52.4 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.4 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  49.8 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  52.4 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  50.6 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  52.96 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2110  ABC transporter related  51.39 
 
 		 254 aa  252  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.6 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  49.4 
 
 		 268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.2 
 
 		 256 aa  251  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  48.79 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  49.41 
 
 		 257 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  47.41 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  51.59 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  49.41 
 
 		 259 aa  248  5e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  49.4 
 
 		 255 aa  248  5e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>