More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2110 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2110  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  56.22 
 
 		 261 aa  291  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  54.94 
 
 		 276 aa  286  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  56.4 
 
 		 259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  56.57 
 
 		 255 aa  282  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  56.18 
 
 		 265 aa  281  9e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  55.56 
 
 		 271 aa  278  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  54.18 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  53.57 
 
 		 271 aa  275  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  56.22 
 
 		 256 aa  274  9e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  54.22 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  53.15 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  52.76 
 
 		 258 aa  271  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  54.44 
 
 		 270 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  54.18 
 
 		 259 aa  271  7e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  54.44 
 
 		 270 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  52.76 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  52.73 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  54.32 
 
 		 271 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  52.76 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  52.76 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  53.15 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  52.19 
 
 		 258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.36 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2499  ABC transporter related  58.17 
 
 		 264 aa  268  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.513432  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  54.03 
 
 		 270 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  53.73 
 
 		 262 aa  268  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  51.97 
 
 		 264 aa  268  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  54.4 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  51 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  51.79 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  50.37 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  51.39 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.9 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  51.79 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  51.79 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  53.97 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  54.9 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  51.39 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  52.21 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  49.8 
 
 		 255 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  53.78 
 
 		 254 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 		 254 aa  264  8e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  50 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  54.51 
 
 		 257 aa  263  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  51 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  52.76 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  50.4 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  51 
 
 		 258 aa  262  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  50.6 
 
 		 260 aa  262  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  50.79 
 
 		 258 aa  261  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  51.59 
 
 		 255 aa  261  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  53.82 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  52.99 
 
 		 280 aa  259  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  53.01 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  52.36 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  51.59 
 
 		 252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  51.39 
 
 		 334 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  50.6 
 
 		 273 aa  258  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  51.97 
 
 		 259 aa  258  8e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  50.2 
 
 		 261 aa  258  9e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  51.21 
 
 		 268 aa  257  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  50 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  50 
 
 		 256 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  50.19 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  50.2 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  52.36 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  49.6 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  52.36 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  49.6 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  53.01 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  51.59 
 
 		 264 aa  255  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  52.42 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  50.39 
 
 		 277 aa  255  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  52.36 
 
 		 257 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.59 
 
 		 255 aa  254  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  52.21 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  49.41 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  50.6 
 
 		 256 aa  253  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.97 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  51.97 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  50.2 
 
 		 333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.97 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.97 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.97 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.97 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  51.39 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  50.98 
 
 		 261 aa  252  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  52.46 
 
 		 283 aa  252  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  51.18 
 
 		 270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  51.44 
 
 		 273 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  50.2 
 
 		 264 aa  252  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  53.82 
 
 		 265 aa  251  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  53.82 
 
 		 265 aa  251  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  51.57 
 
 		 257 aa  251  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>