More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1579 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
254 aa  510  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  78.66 
 
 
254 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  61.26 
 
 
261 aa  315  4e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  60.08 
 
 
255 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  59.52 
 
 
259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  59.36 
 
 
252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  55 
 
 
261 aa  291  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  57.09 
 
 
255 aa  291  5e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  58.57 
 
 
252 aa  291  6e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  55.78 
 
 
264 aa  286  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  55.78 
 
 
265 aa  286  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2499  ABC transporter related  57.48 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.513432  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  55.02 
 
 
256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  54.58 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  54.4 
 
 
271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  54.98 
 
 
286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  53.54 
 
 
259 aa  280  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  55.56 
 
 
259 aa  279  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  52.99 
 
 
259 aa  276  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  52.96 
 
 
273 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  54.98 
 
 
252 aa  275  5e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  53.2 
 
 
271 aa  275  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  50.97 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  55.78 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  51.47 
 
 
284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  53.6 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  53.01 
 
 
258 aa  272  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  54.22 
 
 
261 aa  271  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  51.57 
 
 
261 aa  271  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  54.22 
 
 
268 aa  270  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  53.31 
 
 
265 aa  270  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  52.94 
 
 
258 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  50 
 
 
270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  50.74 
 
 
284 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  51 
 
 
270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  51.41 
 
 
259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  53.36 
 
 
255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  51.6 
 
 
263 aa  267  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  51.41 
 
 
255 aa  267  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  51.56 
 
 
262 aa  267  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  52.19 
 
 
263 aa  266  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  56.28 
 
 
271 aa  266  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  51.41 
 
 
276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  48.77 
 
 
302 aa  266  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  54.18 
 
 
280 aa  265  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  53.82 
 
 
275 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  53.82 
 
 
275 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  53.82 
 
 
275 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0565  ABC transporter related  50.39 
 
 
255 aa  265  5e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0274891  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  53.2 
 
 
334 aa  265  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  49.82 
 
 
307 aa  264  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  49.8 
 
 
256 aa  263  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  54.22 
 
 
294 aa  261  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  51.78 
 
 
255 aa  261  8.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  50.79 
 
 
256 aa  260  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  51.39 
 
 
251 aa  260  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  52.17 
 
 
255 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  51.98 
 
 
256 aa  258  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  51.41 
 
 
250 aa  258  9e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  52.4 
 
 
283 aa  258  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  50.6 
 
 
333 aa  258  9e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  51.78 
 
 
255 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  51 
 
 
258 aa  257  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  50.79 
 
 
256 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  52.4 
 
 
293 aa  256  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  49.08 
 
 
288 aa  255  4e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  53.78 
 
 
255 aa  255  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.19 
 
 
254 aa  254  7e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 
255 aa  254  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 
255 aa  254  8e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  49.8 
 
 
270 aa  254  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  46.99 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  50.81 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  48.43 
 
 
277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0519  ABC transporter related  47.43 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 
270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 
270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  49.21 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  51.39 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  50.4 
 
 
257 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4334  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49 
 
 
255 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231493  normal  0.133886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  51.39 
 
 
250 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3869  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 
256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0107  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.2 
 
 
256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  51 
 
 
250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  50.98 
 
 
257 aa  251  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2110  ABC transporter related  53.39 
 
 
254 aa  251  7e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  49.4 
 
 
260 aa  251  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  49.6 
 
 
257 aa  251  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  49.4 
 
 
273 aa  250  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 
258 aa  250  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  49.6 
 
 
258 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  50 
 
 
257 aa  250  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.19 
 
 
251 aa  250  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  49.8 
 
 
255 aa  249  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  49.6 
 
 
258 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0101  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 
256 aa  249  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  49 
 
 
260 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  49 
 
 
260 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  49.6 
 
 
258 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>