More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2251 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  517  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  87.4 
 
 		 255 aa  454  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  78.82 
 
 		 255 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  71.26 
 
 		 255 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  68.5 
 
 		 255 aa  363  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  68.11 
 
 		 256 aa  363  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  56.97 
 
 		 264 aa  289  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  56.97 
 
 		 265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  55.78 
 
 		 259 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  56.13 
 
 		 275 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  56.13 
 
 		 275 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  56.13 
 
 		 275 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  55.95 
 
 		 283 aa  281  9e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  53.54 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  55.56 
 
 		 293 aa  278  7e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  54.94 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  53.97 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  56.22 
 
 		 255 aa  276  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  54.15 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  52.38 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  52.51 
 
 		 261 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  53.78 
 
 		 270 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  53.78 
 
 		 270 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.78 
 
 		 270 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  51.38 
 
 		 271 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  55.73 
 
 		 255 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  54.4 
 
 		 270 aa  268  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  52.78 
 
 		 259 aa  268  8e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.02 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  51.36 
 
 		 262 aa  265  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  50.78 
 
 		 262 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  52 
 
 		 259 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  52.02 
 
 		 258 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  51.61 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  52.02 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  52.02 
 
 		 258 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  52.02 
 
 		 258 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  52.02 
 
 		 258 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  51.38 
 
 		 259 aa  262  4.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  52.55 
 
 		 273 aa  261  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  56.8 
 
 		 261 aa  261  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  50.4 
 
 		 256 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 252 aa  261  8e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  51.2 
 
 		 256 aa  261  8e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  54.69 
 
 		 261 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  51.98 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  51 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  49.8 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  52.78 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  50.4 
 
 		 257 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  51.78 
 
 		 334 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  49.8 
 
 		 256 aa  258  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  53.01 
 
 		 253 aa  258  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  52.57 
 
 		 280 aa  258  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  52.02 
 
 		 253 aa  258  9e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6414  ABC transporter related  54.25 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  47.22 
 
 		 302 aa  256  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  50.59 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  46.53 
 
 		 307 aa  255  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  50.2 
 
 		 258 aa  255  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  51.56 
 
 		 263 aa  254  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  50.6 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  50.2 
 
 		 252 aa  253  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  51.42 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  50.6 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.8 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  50.6 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  50.6 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  51.21 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  52.67 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  48.21 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  50.97 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  50.79 
 
 		 255 aa  252  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  50.39 
 
 		 261 aa  252  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  52.76 
 
 		 294 aa  252  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  52.02 
 
 		 258 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  50.99 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  52.02 
 
 		 258 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  49.6 
 
 		 251 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  49.2 
 
 		 252 aa  251  7e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  49.21 
 
 		 271 aa  251  8.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  50.2 
 
 		 256 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  52.02 
 
 		 257 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 257 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.21 
 
 		 261 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0654  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.6 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.6 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4429  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.6 
 
 		 257 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108866 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  48.35 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  49.2 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  51.21 
 
 		 257 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  50 
 
 		 259 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  51 
 
 		 594 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.21 
 
 		 257 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  52.59 
 
 		 257 aa  249  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>