More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3322 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  94.28 
 
 		 594 aa  1117    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  61.38 
 
 		 593 aa  734    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  72.9 
 
 		 608 aa  777    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  59.79 
 
 		 590 aa  671    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  94.28 
 
 		 594 aa  1117    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  94.11 
 
 		 594 aa  1115    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  62.91 
 
 		 604 aa  691    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  60.7 
 
 		 951 aa  688    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  62.92 
 
 		 597 aa  708    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  64.36 
 
 		 950 aa  758    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  72.56 
 
 		 613 aa  795    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  86.87 
 
 		 594 aa  1037    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  94.28 
 
 		 594 aa  1117    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  94.11 
 
 		 594 aa  1115    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  85.86 
 
 		 594 aa  1032    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  87.04 
 
 		 594 aa  1040    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  56.9 
 
 		 599 aa  657    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  73.06 
 
 		 608 aa  824    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  100 
 
 		 594 aa  1174    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  94.11 
 
 		 594 aa  1115    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  60.65 
 
 		 589 aa  660    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  58.89 
 
 		 590 aa  644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  59.62 
 
 		 598 aa  696    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  60.62 
 
 		 589 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  84.68 
 
 		 594 aa  1011    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  84.34 
 
 		 594 aa  1013    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  84.85 
 
 		 594 aa  1018    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  60.1 
 
 		 589 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  72.44 
 
 		 617 aa  827    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  63.18 
 
 		 597 aa  689    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  86.87 
 
 		 594 aa  1042    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  86.7 
 
 		 594 aa  1036    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  94.11 
 
 		 594 aa  1115    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  87.04 
 
 		 594 aa  1043    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  73.06 
 
 		 608 aa  824    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  58.64 
 
 		 588 aa  653    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  86.36 
 
 		 594 aa  1037    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  59.02 
 
 		 590 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  56.03 
 
 		 630 aa  607  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  57.68 
 
 		 608 aa  605  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  53.42 
 
 		 583 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  51.98 
 
 		 589 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  56.09 
 
 		 631 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  57.32 
 
 		 586 aa  571  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  52.83 
 
 		 954 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  53.17 
 
 		 595 aa  551  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  51.01 
 
 		 604 aa  526  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  48.85 
 
 		 589 aa  521  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  53.68 
 
 		 625 aa  525  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.18 
 
 		 596 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  48.94 
 
 		 590 aa  504  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  34.09 
 
 		 614 aa  317  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  36.44 
 
 		 599 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  33.82 
 
 		 643 aa  292  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  35.24 
 
 		 593 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  37.28 
 
 		 608 aa  290  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  34.49 
 
 		 610 aa  290  7e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  33.69 
 
 		 663 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  33.08 
 
 		 648 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  34.62 
 
 		 593 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  35.65 
 
 		 606 aa  279  8e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  36.51 
 
 		 611 aa  279  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  35.53 
 
 		 612 aa  279  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  33.28 
 
 		 647 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  34.27 
 
 		 593 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 611 aa  276  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  33.17 
 
 		 646 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  35.1 
 
 		 679 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  33.78 
 
 		 823 aa  270  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  34.55 
 
 		 823 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  31.52 
 
 		 643 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  32.87 
 
 		 582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.69 
 
 		 646 aa  266  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  33.66 
 
 		 660 aa  265  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  35.1 
 
 		 678 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  34.29 
 
 		 682 aa  259  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  35.02 
 
 		 616 aa  256  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.4 
 
 		 256 aa  254  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  35.5 
 
 		 827 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  35.55 
 
 		 832 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  33.1 
 
 		 603 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  34.04 
 
 		 830 aa  251  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  32.06 
 
 		 565 aa  251  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  32.78 
 
 		 852 aa  250  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  32.87 
 
 		 632 aa  249  9e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  51 
 
 		 255 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  49.8 
 
 		 255 aa  248  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2146  ABC transporter related  32.45 
 
 		 606 aa  248  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  36.52 
 
 		 828 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  34.8 
 
 		 822 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  50.2 
 
 		 255 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  34.12 
 
 		 624 aa  240  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  33.62 
 
 		 616 aa  240  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  30.93 
 
 		 842 aa  239  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  50.4 
 
 		 265 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5601  ABC transporter related protein  33.28 
 
 		 563 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  32.05 
 
 		 625 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  49.2 
 
 		 261 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  50.98 
 
 		 280 aa  238  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  49.01 
 
 		 334 aa  237  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>