More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0470 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  100 
 
 
259 aa  519  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  76.68 
 
 
261 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  66.27 
 
 
256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2493  ATPase  63.35 
 
 
253 aa  297  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.509361  hitchhiker  0.00272888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  55.16 
 
 
271 aa  279  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  56.75 
 
 
261 aa  276  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  53.57 
 
 
259 aa  276  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  53.52 
 
 
265 aa  276  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  52.71 
 
 
260 aa  271  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  54.98 
 
 
259 aa  271  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  51.79 
 
 
255 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  53.17 
 
 
258 aa  269  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  54.55 
 
 
264 aa  268  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  52.96 
 
 
255 aa  268  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  53.54 
 
 
256 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  53.78 
 
 
259 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  52.55 
 
 
258 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  52.76 
 
 
283 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  54.62 
 
 
276 aa  266  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.17 
 
 
258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  49.03 
 
 
263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  52.78 
 
 
253 aa  265  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  53.78 
 
 
257 aa  265  8e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1214  ABC transporter related  56.18 
 
 
260 aa  263  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  50.2 
 
 
259 aa  263  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  52.17 
 
 
257 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  52.17 
 
 
257 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  51.16 
 
 
260 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  51.16 
 
 
260 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  52.38 
 
 
255 aa  262  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  51.39 
 
 
271 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  52.36 
 
 
293 aa  262  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.37 
 
 
258 aa  261  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  51.76 
 
 
258 aa  261  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  51.41 
 
 
333 aa  260  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  51.37 
 
 
258 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  51.37 
 
 
258 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  55.02 
 
 
270 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  54.62 
 
 
270 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  51.78 
 
 
256 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  51.81 
 
 
334 aa  259  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  53.41 
 
 
256 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  51 
 
 
255 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  55.28 
 
 
270 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  52.96 
 
 
275 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  52.96 
 
 
275 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  52.96 
 
 
275 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  52.19 
 
 
280 aa  258  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  51.37 
 
 
258 aa  258  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  50.59 
 
 
258 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  50.59 
 
 
258 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  50.59 
 
 
258 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  50.2 
 
 
265 aa  258  8e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  50.98 
 
 
258 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  50.98 
 
 
258 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  49 
 
 
256 aa  258  8e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  54.8 
 
 
264 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2110  ABC transporter related  54.22 
 
 
254 aa  256  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.81 
 
 
257 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  52.19 
 
 
258 aa  255  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  49.4 
 
 
264 aa  255  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  49.8 
 
 
268 aa  254  7e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  52.63 
 
 
271 aa  254  9e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  51.39 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  48.86 
 
 
284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  49.82 
 
 
288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  50 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  49.2 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  50.4 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  50.6 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  48.48 
 
 
284 aa  253  3e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  52.57 
 
 
261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  51.79 
 
 
257 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  48.61 
 
 
255 aa  251  6e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  51.37 
 
 
258 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  51.37 
 
 
258 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  47.4 
 
 
307 aa  251  8.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  50.19 
 
 
264 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  50 
 
 
261 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  52.19 
 
 
257 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.79 
 
 
257 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.79 
 
 
257 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  51.79 
 
 
257 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.79 
 
 
257 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 
257 aa  250  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  52.42 
 
 
257 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.79 
 
 
257 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.42 
 
 
257 aa  250  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  50.6 
 
 
270 aa  250  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.79 
 
 
257 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  52.82 
 
 
257 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.18 
 
 
255 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  51 
 
 
252 aa  250  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  53.01 
 
 
294 aa  249  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  50 
 
 
256 aa  249  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.61 
 
 
255 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.78 
 
 
255 aa  248  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  49 
 
 
250 aa  248  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  47.2 
 
 
302 aa  248  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>