More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2999 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  100 
 
 
264 aa  534  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  85.38 
 
 
260 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  85.38 
 
 
260 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  85.38 
 
 
260 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  85.77 
 
 
255 aa  447  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  84.71 
 
 
256 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  83.92 
 
 
257 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  83.14 
 
 
257 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  83.79 
 
 
255 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  84.19 
 
 
258 aa  432  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  82.58 
 
 
264 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  81.03 
 
 
258 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  69.92 
 
 
257 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  71.21 
 
 
258 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  69.65 
 
 
258 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  69.65 
 
 
258 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  68.87 
 
 
258 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  70.82 
 
 
258 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  70.82 
 
 
258 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  70.82 
 
 
258 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  71.21 
 
 
258 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  68.09 
 
 
258 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  70.04 
 
 
258 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.88 
 
 
257 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  70.04 
 
 
258 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.88 
 
 
257 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.88 
 
 
257 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  71.88 
 
 
257 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.88 
 
 
257 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.88 
 
 
257 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  71.48 
 
 
257 aa  364  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.88 
 
 
257 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  71.09 
 
 
257 aa  363  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6414  ABC transporter related  73.91 
 
 
258 aa  359  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476451  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  70.2 
 
 
257 aa  359  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  70.04 
 
 
258 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  70.04 
 
 
258 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  64.29 
 
 
257 aa  330  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  64.92 
 
 
256 aa  326  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  64.54 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  64.96 
 
 
257 aa  319  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  54.8 
 
 
255 aa  275  8e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  56.5 
 
 
271 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1445  ABC transporter related  71.07 
 
 
216 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  53.46 
 
 
275 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  53.46 
 
 
293 aa  270  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  53.46 
 
 
275 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  53.46 
 
 
275 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  53.08 
 
 
283 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  54.55 
 
 
259 aa  268  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  52.59 
 
 
256 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  53.1 
 
 
334 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  54.03 
 
 
276 aa  266  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  54.58 
 
 
270 aa  265  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  55.02 
 
 
261 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  54.05 
 
 
333 aa  261  8e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  53.23 
 
 
271 aa  258  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  52.19 
 
 
259 aa  256  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  52.99 
 
 
258 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  54.33 
 
 
261 aa  255  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  52.33 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  53.23 
 
 
255 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
255 aa  251  9.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  51.76 
 
 
271 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  51.55 
 
 
262 aa  250  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  48.82 
 
 
265 aa  250  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  51.57 
 
 
294 aa  249  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  48.12 
 
 
307 aa  249  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  49.81 
 
 
271 aa  249  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  50.6 
 
 
256 aa  249  5e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  49.61 
 
 
270 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.39 
 
 
255 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  48.45 
 
 
302 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  49.4 
 
 
263 aa  246  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  50.81 
 
 
255 aa  246  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  47.6 
 
 
250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  49.6 
 
 
250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  49.04 
 
 
262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  47.98 
 
 
251 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  50.2 
 
 
280 aa  242  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  48.79 
 
 
250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 
256 aa  242  5e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  48.43 
 
 
261 aa  242  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  52.38 
 
 
256 aa  242  6e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  49.4 
 
 
257 aa  241  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  50.4 
 
 
265 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  49.6 
 
 
251 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  50.4 
 
 
265 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  48.21 
 
 
259 aa  240  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 
256 aa  240  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  50.8 
 
 
270 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  49 
 
 
257 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  51.16 
 
 
261 aa  239  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.99 
 
 
255 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  50.8 
 
 
270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  48.59 
 
 
263 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.59 
 
 
255 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  47.18 
 
 
253 aa  239  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.59 
 
 
255 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>