More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1445 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1445  ABC transporter related  100 
 
 		 216 aa  443  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  85.65 
 
 		 257 aa  361  4e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  73.87 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  73.37 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  70.3 
 
 		 258 aa  294  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  71 
 
 		 258 aa  294  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  70.3 
 
 		 258 aa  293  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.36 
 
 		 257 aa  292  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  70 
 
 		 258 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  70 
 
 		 258 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  70 
 
 		 258 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  71.36 
 
 		 258 aa  291  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  71.36 
 
 		 258 aa  291  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  69.31 
 
 		 258 aa  290  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  69.31 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  68.32 
 
 		 255 aa  288  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  69.31 
 
 		 256 aa  288  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.84 
 
 		 258 aa  288  6e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  71.07 
 
 		 264 aa  287  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  70.85 
 
 		 257 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  67.33 
 
 		 255 aa  284  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  70.85 
 
 		 257 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  67.82 
 
 		 257 aa  282  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71 
 
 		 257 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71 
 
 		 257 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  71 
 
 		 257 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71 
 
 		 257 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.5 
 
 		 257 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71 
 
 		 257 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71 
 
 		 257 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  69.31 
 
 		 257 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  69.31 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  69.31 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  67.33 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  67.33 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  66.83 
 
 		 257 aa  278  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6414  ABC transporter related  71.5 
 
 		 258 aa  276  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  67 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  67.34 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  68.81 
 
 		 264 aa  275  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  66.83 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  57.29 
 
 		 257 aa  235  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  59.8 
 
 		 255 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  59.02 
 
 		 271 aa  232  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  58.5 
 
 		 276 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  56.5 
 
 		 258 aa  225  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  56 
 
 		 334 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  57.29 
 
 		 293 aa  224  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  55.5 
 
 		 256 aa  221  6e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  56.28 
 
 		 283 aa  221  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  56.28 
 
 		 275 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  56.28 
 
 		 275 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  56.28 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  56.1 
 
 		 261 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  56.28 
 
 		 333 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  54.63 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  53.47 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  55.28 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  56.5 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  55.61 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  54.5 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  55 
 
 		 265 aa  214  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  51.27 
 
 		 251 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  52.97 
 
 		 250 aa  214  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  54.23 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  53.88 
 
 		 261 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  53.5 
 
 		 259 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  54 
 
 		 271 aa  211  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  52.2 
 
 		 259 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  58.29 
 
 		 294 aa  211  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  53.88 
 
 		 270 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  53.5 
 
 		 280 aa  209  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  52.76 
 
 		 270 aa  209  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  53 
 
 		 255 aa  209  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  54.15 
 
 		 262 aa  208  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  50.74 
 
 		 251 aa  207  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  53.69 
 
 		 263 aa  207  8e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  51.74 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  52.71 
 
 		 273 aa  204  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  49.03 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  48.78 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  51.27 
 
 		 250 aa  202  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  52.53 
 
 		 261 aa  201  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  51.24 
 
 		 257 aa  201  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  50.5 
 
 		 255 aa  201  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  50.24 
 
 		 265 aa  199  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  47.06 
 
 		 302 aa  199  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  50.75 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  51.23 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  50.5 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  51.26 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  50.5 
 
 		 648 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  47.66 
 
 		 307 aa  197  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.5 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  50.25 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  51.52 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  48.74 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  51.24 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  49.25 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  51.49 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>