More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3250 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  100 
 
 
261 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  76.68 
 
 
259 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  64.29 
 
 
256 aa  318  5e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2493  ATPase  64.68 
 
 
253 aa  298  6e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.509361  hitchhiker  0.00272888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  55.73 
 
 
271 aa  279  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  55.02 
 
 
258 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  54.9 
 
 
259 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2110  ABC transporter related  56.22 
 
 
254 aa  275  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  50.38 
 
 
265 aa  274  9e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  55.38 
 
 
276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  52.17 
 
 
259 aa  273  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  51.19 
 
 
255 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  52.78 
 
 
259 aa  271  6e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  51.81 
 
 
255 aa  270  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  54.55 
 
 
261 aa  268  8e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  52.36 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  52.76 
 
 
255 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  53.49 
 
 
260 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  55.02 
 
 
264 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  51.76 
 
 
258 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  52.61 
 
 
258 aa  261  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  52.21 
 
 
258 aa  261  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  54.4 
 
 
256 aa  261  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  52.96 
 
 
260 aa  261  8e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  52.96 
 
 
260 aa  261  8e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  51.37 
 
 
258 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  53.2 
 
 
256 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  51.37 
 
 
258 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  51.37 
 
 
258 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  51.18 
 
 
257 aa  260  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  51.37 
 
 
258 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.98 
 
 
258 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.8 
 
 
258 aa  259  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  50.79 
 
 
257 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  49.4 
 
 
256 aa  259  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  52.71 
 
 
293 aa  258  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 
257 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  51.57 
 
 
257 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 
257 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 
257 aa  258  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 
257 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 
257 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 
257 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  52.61 
 
 
283 aa  258  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  51.37 
 
 
258 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  51.37 
 
 
258 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  50.79 
 
 
257 aa  257  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  52.19 
 
 
275 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  52.19 
 
 
275 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  51.98 
 
 
257 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  52.19 
 
 
275 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  54.03 
 
 
270 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.39 
 
 
257 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  53.7 
 
 
264 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.79 
 
 
257 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  50.98 
 
 
258 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  51.78 
 
 
256 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.63 
 
 
270 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  46.38 
 
 
284 aa  256  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  49.15 
 
 
302 aa  255  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  46.01 
 
 
284 aa  255  5e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  49.61 
 
 
270 aa  254  7e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  50.98 
 
 
258 aa  254  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  50.98 
 
 
258 aa  254  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  52.19 
 
 
280 aa  254  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  51.18 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  51.55 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  49.6 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  51.39 
 
 
333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  53.63 
 
 
270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  51 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  52.63 
 
 
271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  50.39 
 
 
257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  48.35 
 
 
288 aa  252  5.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  51.79 
 
 
263 aa  251  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  47.43 
 
 
263 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  48.79 
 
 
307 aa  251  9.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 
256 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2499  ABC transporter related  53.17 
 
 
264 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.513432  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  50.4 
 
 
256 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  48 
 
 
259 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  49.61 
 
 
261 aa  249  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  50.8 
 
 
258 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  50 
 
 
258 aa  249  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  50 
 
 
255 aa  248  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1214  ABC transporter related  56 
 
 
260 aa  248  8e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  49.8 
 
 
268 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  48.4 
 
 
252 aa  248  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  50.4 
 
 
255 aa  247  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6414  ABC transporter related  50.59 
 
 
258 aa  246  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476451  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  49.61 
 
 
261 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.59 
 
 
255 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  48.06 
 
 
262 aa  246  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  47.2 
 
 
265 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  49.21 
 
 
255 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.59 
 
 
256 aa  246  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.19 
 
 
256 aa  246  4e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.59 
 
 
256 aa  246  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  49.61 
 
 
256 aa  246  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>