More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0273 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  510  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  67.6 
 
 		 257 aa  350  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  67.59 
 
 		 258 aa  347  8e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  65.08 
 
 		 255 aa  335  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  65.74 
 
 		 260 aa  334  7e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  65.74 
 
 		 260 aa  334  7e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  65.74 
 
 		 260 aa  334  7.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.47 
 
 		 257 aa  334  9e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  66.27 
 
 		 258 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  65.87 
 
 		 258 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  65.87 
 
 		 258 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  65.87 
 
 		 258 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  64.82 
 
 		 255 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  66.27 
 
 		 258 aa  332  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  66.27 
 
 		 258 aa  332  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  65.48 
 
 		 258 aa  332  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.82 
 
 		 258 aa  331  8e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  65.08 
 
 		 258 aa  330  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  65.87 
 
 		 258 aa  330  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  63.1 
 
 		 257 aa  328  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  65.08 
 
 		 258 aa  327  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  63.1 
 
 		 257 aa  327  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  64.68 
 
 		 258 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  64.68 
 
 		 256 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.54 
 
 		 257 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  66.54 
 
 		 257 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.54 
 
 		 257 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.54 
 
 		 257 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.54 
 
 		 257 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.54 
 
 		 257 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.54 
 
 		 257 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  65.48 
 
 		 258 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  64.54 
 
 		 264 aa  320  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  65.48 
 
 		 258 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  65.87 
 
 		 257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  64.94 
 
 		 257 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  64.94 
 
 		 257 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  66.53 
 
 		 264 aa  313  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6414  ABC transporter related  63.1 
 
 		 258 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  61.75 
 
 		 257 aa  289  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  58.4 
 
 		 293 aa  285  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  58 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  58 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  58 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  56.8 
 
 		 283 aa  280  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  56.4 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  58.06 
 
 		 256 aa  274  9e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  55.56 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  57.14 
 
 		 333 aa  272  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  55.95 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  53.94 
 
 		 270 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  56.35 
 
 		 334 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  53.01 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  57.37 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  55.42 
 
 		 271 aa  265  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  53.15 
 
 		 261 aa  265  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  52.78 
 
 		 259 aa  265  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  56.05 
 
 		 280 aa  265  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  52.73 
 
 		 262 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  52.78 
 
 		 256 aa  264  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  52.61 
 
 		 264 aa  264  8.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  52.76 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  50.52 
 
 		 307 aa  261  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  53.01 
 
 		 255 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  53.97 
 
 		 276 aa  261  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  52.38 
 
 		 268 aa  260  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  52.42 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  52.42 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  50.7 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  53.01 
 
 		 255 aa  258  6e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  53.01 
 
 		 255 aa  258  8e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  56.45 
 
 		 294 aa  257  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  51.81 
 
 		 259 aa  255  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  52.38 
 
 		 256 aa  255  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  52.21 
 
 		 270 aa  254  7e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  51.18 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  51.97 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  52.42 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1445  ABC transporter related  66.5 
 
 		 216 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  52.4 
 
 		 259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.6 
 
 		 270 aa  251  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  53.2 
 
 		 270 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  51.82 
 
 		 271 aa  249  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  47.79 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  49.4 
 
 		 255 aa  248  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  50.81 
 
 		 250 aa  248  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  47.98 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  48.62 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  52.8 
 
 		 270 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.6 
 
 		 254 aa  247  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  50.2 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  49 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  53.01 
 
 		 256 aa  246  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.2 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 259 aa  245  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01988  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  52.63 
 
 		 265 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.302252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.81 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  48.88 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  52.21 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  48.59 
 
 		 257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>