More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2856 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  100 
 
 
276 aa  553  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  74.44 
 
 
271 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  77.43 
 
 
258 aa  415  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  77.61 
 
 
261 aa  410  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  60.98 
 
 
280 aa  329  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  60.81 
 
 
333 aa  328  8e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  61.39 
 
 
275 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  61.72 
 
 
275 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  61.72 
 
 
275 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  61.72 
 
 
283 aa  322  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  60.07 
 
 
293 aa  322  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  59.77 
 
 
334 aa  317  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  65.74 
 
 
294 aa  311  7.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  55.89 
 
 
302 aa  308  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  55.86 
 
 
307 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.73 
 
 
256 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  59.68 
 
 
258 aa  299  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  59.52 
 
 
271 aa  296  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  57.94 
 
 
257 aa  296  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  57.94 
 
 
257 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  58.5 
 
 
258 aa  295  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  58.89 
 
 
258 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  58.89 
 
 
258 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  58.89 
 
 
258 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  58.47 
 
 
258 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  59.27 
 
 
258 aa  292  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  54.18 
 
 
256 aa  288  7e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  56.3 
 
 
264 aa  286  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  57.09 
 
 
255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  58.89 
 
 
258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  58.89 
 
 
258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  58.06 
 
 
257 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.63 
 
 
258 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  57.66 
 
 
270 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0344  ABC transporter related  58.14 
 
 
336 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.952475  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  54.76 
 
 
255 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 
257 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  59.68 
 
 
257 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  58.7 
 
 
271 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.27 
 
 
257 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  57.26 
 
 
270 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  55.65 
 
 
256 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  59.27 
 
 
257 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 
257 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 
257 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 
257 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 
257 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  57.66 
 
 
270 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  54.72 
 
 
265 aa  279  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  54.51 
 
 
260 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  54.51 
 
 
260 aa  279  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.66 
 
 
257 aa  278  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  55.02 
 
 
259 aa  278  8e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  55.6 
 
 
259 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  53.78 
 
 
255 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  55.56 
 
 
262 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  59.27 
 
 
271 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  55.65 
 
 
260 aa  276  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  56.75 
 
 
259 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  54.41 
 
 
262 aa  276  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  52.99 
 
 
256 aa  275  7e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  54.62 
 
 
257 aa  275  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  54.22 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  55.38 
 
 
261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  54.55 
 
 
255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  55.02 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  53.91 
 
 
261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  54.98 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  54.23 
 
 
261 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  58.33 
 
 
260 aa  271  7e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  51.72 
 
 
612 aa  270  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  53.52 
 
 
256 aa  270  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  54.18 
 
 
258 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  52.94 
 
 
284 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  54.18 
 
 
258 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  54.05 
 
 
270 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2110  ABC transporter related  54.94 
 
 
254 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  54.18 
 
 
258 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  55.02 
 
 
273 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  55.95 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  54.8 
 
 
263 aa  269  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  53.79 
 
 
277 aa  268  8e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  53.17 
 
 
255 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.78 
 
 
257 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  55.24 
 
 
256 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  51.21 
 
 
251 aa  266  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  54.62 
 
 
259 aa  266  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.41 
 
 
254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  53.57 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1836  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  52.61 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0865  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  53.01 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154557  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3325  ABC transporter related  52.1 
 
 
354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.268059  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  51.76 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  54.03 
 
 
264 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  53.04 
 
 
268 aa  265  4e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  51.19 
 
 
255 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0775  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  53.01 
 
 
257 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2141  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  53.01 
 
 
257 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558111  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  52.21 
 
 
284 aa  265  5e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  53.17 
 
 
255 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>