More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3392 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  80.08 
 
 		 257 aa  425  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  78.91 
 
 		 257 aa  421  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  64.43 
 
 		 256 aa  326  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  58.73 
 
 		 276 aa  301  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  56.8 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  56.63 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  54.94 
 
 		 271 aa  291  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  57.37 
 
 		 261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  57.47 
 
 		 264 aa  285  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  56.52 
 
 		 261 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  54.22 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  56.7 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  53.82 
 
 		 280 aa  278  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  53.82 
 
 		 334 aa  277  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  53.6 
 
 		 275 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  53.6 
 
 		 275 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  53.6 
 
 		 275 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  55.78 
 
 		 259 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  53.82 
 
 		 293 aa  275  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  49.13 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  51.81 
 
 		 333 aa  272  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  48.43 
 
 		 302 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  55.2 
 
 		 294 aa  269  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  58.87 
 
 		 271 aa  268  5.9999999999999995e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  52.71 
 
 		 270 aa  267  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  51.39 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  54.94 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  51.29 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  53.78 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  52.55 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  53.6 
 
 		 265 aa  265  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  53.6 
 
 		 265 aa  265  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  52.4 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  50.92 
 
 		 284 aa  265  7e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  53.73 
 
 		 259 aa  264  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  53.94 
 
 		 265 aa  264  8.999999999999999e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.2 
 
 		 258 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  52.19 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  50.59 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  53.12 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  55.34 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  52.99 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  50.59 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  52.17 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  51.39 
 
 		 256 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  52.96 
 
 		 258 aa  261  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  51.19 
 
 		 256 aa  261  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  52.96 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  52.96 
 
 		 258 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  52.96 
 
 		 258 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  52.96 
 
 		 258 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  52.17 
 
 		 255 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.59 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  52.14 
 
 		 270 aa  259  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  52.59 
 
 		 255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  52.99 
 
 		 256 aa  258  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.57 
 
 		 258 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  53.23 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  55.12 
 
 		 260 aa  258  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  50.72 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  51.79 
 
 		 263 aa  257  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  51 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  51 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  50.4 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  52.61 
 
 		 612 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  51.41 
 
 		 594 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  48.62 
 
 		 252 aa  255  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  51.81 
 
 		 594 aa  255  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  51.57 
 
 		 270 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  51.2 
 
 		 253 aa  254  7e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  51.41 
 
 		 594 aa  254  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  51.41 
 
 		 594 aa  254  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  52.85 
 
 		 271 aa  254  9e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  51 
 
 		 594 aa  254  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  51.59 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  52.4 
 
 		 594 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  51.57 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  51.41 
 
 		 594 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  52 
 
 		 594 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  52.59 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  52 
 
 		 594 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  51.57 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  49.04 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  52 
 
 		 594 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  52.17 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  50.79 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  52 
 
 		 594 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  52 
 
 		 594 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  52 
 
 		 594 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  51.98 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  50.79 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  52 
 
 		 594 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  51 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  53.39 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  51.75 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  51 
 
 		 594 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  51.36 
 
 		 261 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  49.41 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>