More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1389 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  522  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  59.36 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  54.18 
 
 		 256 aa  296  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  54.33 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0565  ABC transporter related  54.9 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0274891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 259 aa  288  8e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  55.16 
 
 		 259 aa  284  8e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  56.22 
 
 		 259 aa  284  9e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  56.85 
 
 		 270 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  56.85 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  54.4 
 
 		 286 aa  280  1e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  56.05 
 
 		 271 aa  280  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  56.18 
 
 		 270 aa  279  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2499  ABC transporter related  58.73 
 
 		 264 aa  279  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.513432  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0519  ABC transporter related  52.59 
 
 		 255 aa  278  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  52.99 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  51.76 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  50.92 
 
 		 284 aa  276  3e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  52.38 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  50.55 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  53.41 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  53.39 
 
 		 258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  54.62 
 
 		 271 aa  272  4.0000000000000004e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  52.61 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  51.39 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  51.59 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  51.56 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.12 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  51.38 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  50.19 
 
 		 261 aa  262  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  52.61 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  52.4 
 
 		 263 aa  260  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  50.78 
 
 		 264 aa  259  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  52.61 
 
 		 283 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  51.76 
 
 		 257 aa  258  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  49.45 
 
 		 288 aa  258  7e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  51 
 
 		 273 aa  257  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  52.19 
 
 		 271 aa  257  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  51.76 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  52.8 
 
 		 294 aa  255  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  51.35 
 
 		 270 aa  254  7e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  51.19 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  51.57 
 
 		 262 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  51.2 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  50.59 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  52.21 
 
 		 293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  47.43 
 
 		 256 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  48.21 
 
 		 254 aa  251  6e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  51.17 
 
 		 271 aa  251  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  51.81 
 
 		 275 aa  251  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  51.81 
 
 		 275 aa  251  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  51.81 
 
 		 275 aa  251  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 		 256 aa  251  1e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  50.2 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  48.63 
 
 		 281 aa  249  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  51 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  50.38 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  50.39 
 
 		 270 aa  248  5e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.59 
 
 		 251 aa  248  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  52.61 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  50.4 
 
 		 333 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  52 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  52 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  50.2 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0684  ABC transporter related protein  53.41 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.003005  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  50.2 
 
 		 261 aa  244  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.79 
 
 		 254 aa  244  9e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  50.8 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  50 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  49.4 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  48.8 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  48.4 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  50.8 
 
 		 258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  47.59 
 
 		 307 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  49.4 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  49.4 
 
 		 261 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  48.99 
 
 		 268 aa  241  7e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2117  ABC transporter related  50.42 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  49.42 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  51.42 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  50.6 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  49.4 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  45.17 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  48 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.21 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2110  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  46.88 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.79 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 		 256 aa  238  6.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  47.41 
 
 		 256 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  50 
 
 		 258 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  50 
 
 		 258 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  50 
 
 		 258 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 		 258 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  48.21 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  51.81 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>