More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2117 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2117  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  524  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  67.73 
 
 		 255 aa  342  4e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0519  ABC transporter related  67.33 
 
 		 255 aa  340  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0565  ABC transporter related  66.14 
 
 		 255 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0274891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  56.63 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  49.6 
 
 		 259 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  48.79 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  50.41 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  49.39 
 
 		 252 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  50.61 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  49.39 
 
 		 271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  48.39 
 
 		 252 aa  244  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  48.99 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  50.42 
 
 		 256 aa  240  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  49 
 
 		 256 aa  240  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.99 
 
 		 258 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  48.85 
 
 		 286 aa  236  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  48.99 
 
 		 258 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  48.18 
 
 		 271 aa  235  5.0000000000000005e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  45.78 
 
 		 259 aa  234  8e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  47.18 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  48.61 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  49.18 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  49.18 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  47.18 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  49.18 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  49.39 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.18 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  47.98 
 
 		 273 aa  232  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  48.99 
 
 		 258 aa  232  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  49.2 
 
 		 262 aa  232  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  46.31 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  47.54 
 
 		 281 aa  231  8.000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  45.35 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  46.06 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  47.79 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  46.37 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  44.98 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.8 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  44.05 
 
 		 261 aa  228  5e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  45.66 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  46.34 
 
 		 264 aa  227  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  46.37 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  45.78 
 
 		 254 aa  225  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  44.91 
 
 		 284 aa  225  6e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  48.58 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  48.58 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  49.18 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  46.96 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  46.72 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  44.44 
 
 		 261 aa  222  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  46.96 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  48.58 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.99 
 
 		 257 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.99 
 
 		 257 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  48.99 
 
 		 257 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 		 257 aa  222  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.99 
 
 		 257 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 276 aa  221  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.99 
 
 		 257 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.99 
 
 		 257 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  45.97 
 
 		 264 aa  221  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 254 aa  221  8e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  46.96 
 
 		 256 aa  221  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  43.95 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.58 
 
 		 257 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  46.96 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  43.2 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  47.77 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  43.58 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  47.37 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  44.98 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  44.66 
 
 		 262 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  42.51 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  45.75 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  42.86 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  46.15 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  46.31 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  46.53 
 
 		 283 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  47.35 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  44.94 
 
 		 274 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  47.35 
 
 		 275 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  47.35 
 
 		 275 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  46.94 
 
 		 293 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  46.72 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  46.31 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  44.13 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.94 
 
 		 279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  46.56 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  46.31 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  46.56 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  46.31 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  46 
 
 		 265 aa  215  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.67 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  46 
 
 		 265 aa  215  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  45.82 
 
 		 257 aa  215  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.67 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>