More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1674 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  100 
 
 
251 aa  504  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  73.31 
 
 
251 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  73.9 
 
 
250 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  72.8 
 
 
250 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  70 
 
 
250 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  69.2 
 
 
250 aa  363  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1731  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.28 
 
 
250 aa  353  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.385774  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  55.02 
 
 
253 aa  280  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  52 
 
 
261 aa  266  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  51.61 
 
 
271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  52.4 
 
 
256 aa  265  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.39 
 
 
254 aa  260  1e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  52.02 
 
 
261 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  51.81 
 
 
265 aa  257  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  51.81 
 
 
259 aa  256  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  47.81 
 
 
256 aa  255  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  50.6 
 
 
252 aa  255  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  51.39 
 
 
275 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  51.39 
 
 
275 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  51.39 
 
 
275 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  50.2 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  50.6 
 
 
283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  50.6 
 
 
293 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  49.6 
 
 
255 aa  251  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  47.77 
 
 
258 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  47.77 
 
 
258 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  47.77 
 
 
258 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  49.6 
 
 
255 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  49.19 
 
 
253 aa  251  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  50.8 
 
 
264 aa  251  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  47.77 
 
 
258 aa  251  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  49.6 
 
 
255 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  48.79 
 
 
276 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  48.81 
 
 
263 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.37 
 
 
258 aa  250  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  48.57 
 
 
271 aa  250  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  49.21 
 
 
265 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.6 
 
 
258 aa  250  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4552  ABC transporter related  52.42 
 
 
260 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  49.19 
 
 
256 aa  249  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  49 
 
 
334 aa  248  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  49.6 
 
 
265 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  49.19 
 
 
257 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  46.96 
 
 
258 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  49.19 
 
 
260 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  46.77 
 
 
258 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  48.79 
 
 
257 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  49 
 
 
270 aa  246  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  49 
 
 
255 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  48.81 
 
 
266 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  47.41 
 
 
259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  47.6 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  49 
 
 
257 aa  244  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  47.18 
 
 
255 aa  244  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  53.04 
 
 
271 aa  244  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  46.96 
 
 
258 aa  244  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  47.01 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  50.4 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  48 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  48.19 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  47.62 
 
 
265 aa  242  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  48.61 
 
 
280 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  50.81 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0677  ABC transporter related  50.81 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  49.4 
 
 
255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  47.98 
 
 
260 aa  242  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  50.2 
 
 
262 aa  242  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  47.98 
 
 
260 aa  242  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  47.98 
 
 
259 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  49.6 
 
 
264 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  48.58 
 
 
268 aa  240  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3819  ABC transporter related  47.41 
 
 
262 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0171499  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  47.58 
 
 
258 aa  240  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  47.37 
 
 
257 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  47.98 
 
 
256 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  45.26 
 
 
302 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  44.91 
 
 
307 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  47.37 
 
 
258 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  47.37 
 
 
258 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48 
 
 
251 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  47.58 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
257 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  47.37 
 
 
257 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
257 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
257 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
257 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
257 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
257 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  45.82 
 
 
612 aa  238  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  49.6 
 
 
257 aa  238  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  46.77 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  46.8 
 
 
252 aa  238  8e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  49.4 
 
 
294 aa  238  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  47.58 
 
 
257 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  46.83 
 
 
259 aa  237  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0998  ABC transporter related  53.17 
 
 
257 aa  237  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  45.38 
 
 
255 aa  237  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  45.82 
 
 
255 aa  237  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  48.18 
 
 
258 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  48.79 
 
 
257 aa  236  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>