More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4240 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  100 
 
 		 266 aa  544  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  88.68 
 
 		 265 aa  487  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  88.3 
 
 		 265 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  83.02 
 
 		 265 aa  461  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0356  ABC transporter related  80.68 
 
 		 290 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  57.03 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  55.64 
 
 		 268 aa  296  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  50.39 
 
 		 261 aa  255  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  49.61 
 
 		 268 aa  251  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  46.69 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  46.67 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  46.46 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  46.25 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  47.71 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  48.81 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  46.85 
 
 		 256 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  47.29 
 
 		 277 aa  245  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  47.17 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  48 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  45.7 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  48.61 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  47.27 
 
 		 280 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  44.44 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  47.6 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.82 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  44.53 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  45.59 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  42.62 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  42.95 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  47.22 
 
 		 296 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  43.82 
 
 		 256 aa  238  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  46.48 
 
 		 255 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  49.38 
 
 		 250 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  45.28 
 
 		 283 aa  238  9e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  44.83 
 
 		 275 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  48.05 
 
 		 285 aa  237  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19620  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.85 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00232655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  45.2 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  45 
 
 		 275 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  45 
 
 		 275 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  45.2 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  45.17 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  46.69 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  46.43 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  46.27 
 
 		 276 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  47.41 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  44.11 
 
 		 269 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  43.6 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  44.75 
 
 		 278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  46.43 
 
 		 282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  46.22 
 
 		 250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  45.17 
 
 		 261 aa  235  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  47.43 
 
 		 292 aa  234  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  46.85 
 
 		 255 aa  234  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  44.18 
 
 		 255 aa  234  9e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  45.28 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  42.8 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  45.06 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  44.8 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.6 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  43.35 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.6 
 
 		 265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  45.49 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  44.4 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  43.02 
 
 		 266 aa  232  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.08 
 
 		 255 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  47.08 
 
 		 292 aa  231  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  43.35 
 
 		 277 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  43.23 
 
 		 280 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 255 aa  231  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  45.24 
 
 		 259 aa  231  9e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.88 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.69 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  42.91 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  44.11 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  43.97 
 
 		 286 aa  229  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  43.37 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  44.66 
 
 		 333 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  44 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  43.58 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2737  ABC transporter related  41.89 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  43.43 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  45.2 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  45.06 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.2 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  45.67 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  40 
 
 		 263 aa  228  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  42.97 
 
 		 270 aa  228  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  45.45 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  43.6 
 
 		 264 aa  228  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  44.57 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  42.8 
 
 		 264 aa  228  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 		 258 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  43.19 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  43.43 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  44.09 
 
 		 264 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  43.92 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>