More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0111 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  52.59 
 
 		 265 aa  262  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  50.6 
 
 		 251 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  52.59 
 
 		 264 aa  261  8e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  51.38 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  50.99 
 
 		 255 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 255 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  52.21 
 
 		 261 aa  246  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  51.18 
 
 		 261 aa  245  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  49.02 
 
 		 255 aa  245  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  50.81 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  47.98 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  49.01 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  47.29 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  49.8 
 
 		 270 aa  242  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0231  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  52.21 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  48.61 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  48.19 
 
 		 271 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  48.4 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  49.42 
 
 		 273 aa  238  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  49.4 
 
 		 259 aa  238  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.58 
 
 		 258 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  47.58 
 
 		 251 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  49.02 
 
 		 283 aa  236  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  48.41 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  48.58 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  51.21 
 
 		 276 aa  236  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  48.58 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  47.18 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  48.05 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  49 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  47.29 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  48.18 
 
 		 258 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  48.18 
 
 		 258 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  46.03 
 
 		 256 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  48.18 
 
 		 258 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  46.77 
 
 		 255 aa  234  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  49.6 
 
 		 250 aa  235  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  46.4 
 
 		 257 aa  234  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1731  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.385774  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  48.62 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  49.8 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  49.6 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  46.4 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  47.66 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  48.39 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  48.62 
 
 		 275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  51.82 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  48.62 
 
 		 275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  48.62 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  46.4 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  49.8 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  49.8 
 
 		 254 aa  232  3e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  48.4 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  46.77 
 
 		 258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  46.18 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  50.6 
 
 		 261 aa  231  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  47.18 
 
 		 258 aa  231  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  48.61 
 
 		 257 aa  230  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  48.44 
 
 		 256 aa  229  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  48.18 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  46.8 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  46.77 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  46.4 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  45.78 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  46.77 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  46.83 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.77 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  47.58 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  44.58 
 
 		 256 aa  229  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3819  ABC transporter related  47.41 
 
 		 262 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0171499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 		 258 aa  228  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  46.8 
 
 		 256 aa  228  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  47.41 
 
 		 333 aa  228  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0101  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.2 
 
 		 256 aa  228  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  46.18 
 
 		 260 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  46.18 
 
 		 260 aa  228  9e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 252 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0107  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  44.4 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  46.59 
 
 		 264 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  49 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.59 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  48.22 
 
 		 265 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  48.22 
 
 		 265 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  48.02 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0654  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.61 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  47.01 
 
 		 334 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  44.8 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.19 
 
 		 255 aa  225  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.61 
 
 		 257 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  45.67 
 
 		 261 aa  224  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 		 257 aa  225  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  45.6 
 
 		 257 aa  224  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  49.8 
 
 		 257 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 		 257 aa  225  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 		 257 aa  225  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 		 257 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>