More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7086 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  59.9 
 
 		 594 aa  670    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  59.9 
 
 		 594 aa  670    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  56.97 
 
 		 950 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  60.93 
 
 		 594 aa  686    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  60.07 
 
 		 594 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  59.9 
 
 		 594 aa  670    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  61.21 
 
 		 594 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  60.93 
 
 		 594 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  60.62 
 
 		 594 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  81.26 
 
 		 589 aa  927    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  58.86 
 
 		 594 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  58.69 
 
 		 594 aa  668    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  80.24 
 
 		 589 aa  914    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  60.76 
 
 		 594 aa  687    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  60.59 
 
 		 594 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  60.07 
 
 		 594 aa  673    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  61.1 
 
 		 594 aa  692    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  79.32 
 
 		 590 aa  914    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  60.59 
 
 		 594 aa  684    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  100 
 
 		 589 aa  1157    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  60.07 
 
 		 594 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  59.9 
 
 		 594 aa  670    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  59.21 
 
 		 594 aa  669    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  55.48 
 
 		 593 aa  631  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  59.24 
 
 		 590 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  56.03 
 
 		 598 aa  630  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  59.97 
 
 		 590 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  57.29 
 
 		 617 aa  629  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  59.08 
 
 		 608 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  59.08 
 
 		 608 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  58.14 
 
 		 597 aa  623  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  57.14 
 
 		 597 aa  613  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  58.74 
 
 		 613 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  56.52 
 
 		 604 aa  607  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  54.9 
 
 		 951 aa  598  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  57.8 
 
 		 608 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  51.91 
 
 		 599 aa  575  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  53.17 
 
 		 589 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  55.61 
 
 		 608 aa  570  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  54.9 
 
 		 630 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  54.55 
 
 		 588 aa  571  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  52.32 
 
 		 583 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  56.18 
 
 		 586 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  53.98 
 
 		 954 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  52.98 
 
 		 631 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.59 
 
 		 596 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  51.5 
 
 		 595 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  48.31 
 
 		 589 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  49.24 
 
 		 604 aa  502  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  53.85 
 
 		 625 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  48.85 
 
 		 590 aa  480  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  36.04 
 
 		 614 aa  326  7e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  35.89 
 
 		 599 aa  302  9e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  37.28 
 
 		 610 aa  296  9e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  33.84 
 
 		 663 aa  295  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  38.2 
 
 		 612 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  33.44 
 
 		 643 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  34.65 
 
 		 593 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  33.55 
 
 		 648 aa  277  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  35.08 
 
 		 608 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  34.95 
 
 		 593 aa  267  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  34.34 
 
 		 582 aa  267  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  36.84 
 
 		 616 aa  267  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5601  ABC transporter related protein  36.68 
 
 		 563 aa  266  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  35.66 
 
 		 606 aa  266  8.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  37.5 
 
 		 832 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  35.43 
 
 		 830 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2146  ABC transporter related  33.28 
 
 		 606 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 611 aa  260  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  36.46 
 
 		 823 aa  259  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  36.28 
 
 		 823 aa  259  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  34.41 
 
 		 593 aa  257  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  33.22 
 
 		 603 aa  257  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  35.25 
 
 		 611 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  33.17 
 
 		 660 aa  252  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  36.06 
 
 		 827 aa  249  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  34.9 
 
 		 616 aa  246  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  35.41 
 
 		 828 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 		 256 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  50.2 
 
 		 255 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  51.38 
 
 		 256 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  33.96 
 
 		 852 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  34.85 
 
 		 624 aa  240  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  49.4 
 
 		 255 aa  239  9e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  49.21 
 
 		 257 aa  239  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  30.82 
 
 		 565 aa  239  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  49.8 
 
 		 255 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  48.41 
 
 		 257 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  49.8 
 
 		 255 aa  236  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  32.27 
 
 		 679 aa  236  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  48 
 
 		 256 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  48.02 
 
 		 255 aa  234  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  48.24 
 
 		 261 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  49.19 
 
 		 253 aa  233  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  48.18 
 
 		 268 aa  233  8.000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  31.81 
 
 		 838 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  33.5 
 
 		 597 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  34.22 
 
 		 594 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.37 
 
 		 609 aa  230  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  52.21 
 
 		 252 aa  230  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>