More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3248 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  100 
 
 		 589 aa  1163    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  57.82 
 
 		 595 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  53.07 
 
 		 950 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  52.84 
 
 		 594 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  52.84 
 
 		 594 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  57.37 
 
 		 604 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  52.84 
 
 		 594 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  52.62 
 
 		 594 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  52.67 
 
 		 594 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  52.27 
 
 		 594 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  52.45 
 
 		 594 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  53.53 
 
 		 594 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  52.67 
 
 		 594 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  52.67 
 
 		 594 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  53.71 
 
 		 594 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  53 
 
 		 594 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  52.67 
 
 		 594 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  53 
 
 		 594 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  53.43 
 
 		 594 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  52.49 
 
 		 594 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  52.66 
 
 		 594 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  51.98 
 
 		 594 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  53.17 
 
 		 589 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  50.68 
 
 		 951 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  52.23 
 
 		 604 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  52.17 
 
 		 597 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  52.67 
 
 		 608 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  52.67 
 
 		 608 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  52.99 
 
 		 589 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  48.74 
 
 		 593 aa  561  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  50.52 
 
 		 597 aa  558  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  51.92 
 
 		 590 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  54.19 
 
 		 608 aa  557  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  52.25 
 
 		 589 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  49.15 
 
 		 599 aa  549  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  50.42 
 
 		 617 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  52.32 
 
 		 613 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  47 
 
 		 598 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  50.68 
 
 		 630 aa  534  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  51.9 
 
 		 608 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  49.31 
 
 		 583 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  49.83 
 
 		 590 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  50.44 
 
 		 590 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  49.05 
 
 		 588 aa  515  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.63 
 
 		 596 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  48.54 
 
 		 631 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  46.52 
 
 		 589 aa  491  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  47.53 
 
 		 954 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  49.73 
 
 		 586 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  49.49 
 
 		 625 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  46.45 
 
 		 590 aa  454  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  36.33 
 
 		 614 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  35.46 
 
 		 643 aa  304  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  35.4 
 
 		 663 aa  298  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  35.5 
 
 		 599 aa  296  9e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  36.95 
 
 		 612 aa  287  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  32.48 
 
 		 648 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  33.39 
 
 		 643 aa  282  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.82 
 
 		 646 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  35.36 
 
 		 647 aa  279  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  36.13 
 
 		 610 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  33.33 
 
 		 646 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  36.14 
 
 		 593 aa  276  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  34.24 
 
 		 593 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  33.39 
 
 		 616 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  35.61 
 
 		 593 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  34.31 
 
 		 606 aa  270  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  34.54 
 
 		 616 aa  266  8.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  34.44 
 
 		 832 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  35.26 
 
 		 608 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  33.28 
 
 		 678 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  36.13 
 
 		 823 aa  251  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  32.58 
 
 		 679 aa  250  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 611 aa  250  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  35.69 
 
 		 611 aa  249  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  35.83 
 
 		 823 aa  249  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  32.2 
 
 		 660 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  33.61 
 
 		 594 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2146  ABC transporter related  33.39 
 
 		 606 aa  248  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  34.68 
 
 		 822 aa  248  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1697  ABC transporter-related protein  32.36 
 
 		 652 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  32.36 
 
 		 652 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  50 
 
 		 255 aa  244  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  33.62 
 
 		 582 aa  244  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  35.81 
 
 		 827 aa  243  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  48 
 
 		 256 aa  242  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  32.51 
 
 		 682 aa  240  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.79 
 
 		 256 aa  239  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  33.8 
 
 		 830 aa  239  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  29.98 
 
 		 565 aa  239  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  35.12 
 
 		 828 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  32.2 
 
 		 632 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2181  ABC branched-chain amino acid transporter, fused ATPase and inner-membrane subunits  32.31 
 
 		 652 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  31.65 
 
 		 625 aa  236  8e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  48.39 
 
 		 255 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5601  ABC transporter related protein  34.67 
 
 		 563 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  49.22 
 
 		 334 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  49 
 
 		 271 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  48.66 
 
 		 333 aa  233  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  47.89 
 
 		 276 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>