More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0357 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  68.27 
 
 
646 aa  832    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  63.38 
 
 
648 aa  798    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  68.48 
 
 
646 aa  840    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  100 
 
 
643 aa  1295    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  67.34 
 
 
647 aa  812    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  58.19 
 
 
678 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  60.27 
 
 
663 aa  745    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  69.89 
 
 
643 aa  896    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  57.84 
 
 
679 aa  632  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  57.12 
 
 
682 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1697  ABC transporter-related protein  42.58 
 
 
652 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  42.83 
 
 
652 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2181  ABC branched-chain amino acid transporter, fused ATPase and inner-membrane subunits  42.58 
 
 
652 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1684  ABC transporter related  37.67 
 
 
629 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0459583  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0478  ABC transporter related  38.01 
 
 
634 aa  378  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  37.4 
 
 
593 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  36.64 
 
 
593 aa  365  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  36.41 
 
 
606 aa  362  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  33.93 
 
 
593 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  35.18 
 
 
599 aa  323  4e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  33.23 
 
 
608 aa  316  8e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  32.36 
 
 
660 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  32.98 
 
 
594 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  33.83 
 
 
616 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  32.61 
 
 
593 aa  312  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  31.96 
 
 
594 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  34.17 
 
 
608 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.8 
 
 
594 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  31.96 
 
 
594 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  32.15 
 
 
594 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.89 
 
 
594 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  32.31 
 
 
594 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  32.15 
 
 
594 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  31.96 
 
 
594 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.96 
 
 
594 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.96 
 
 
594 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.96 
 
 
594 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  31.8 
 
 
594 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.8 
 
 
594 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  32.15 
 
 
594 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.8 
 
 
594 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  32.15 
 
 
594 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  31.55 
 
 
589 aa  302  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  32.74 
 
 
823 aa  299  9e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  32.65 
 
 
598 aa  297  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  32.35 
 
 
822 aa  296  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  31.44 
 
 
589 aa  296  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  31.52 
 
 
594 aa  295  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  32.17 
 
 
604 aa  294  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  31.79 
 
 
823 aa  293  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  32.7 
 
 
583 aa  293  8e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  32.76 
 
 
588 aa  293  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  32.17 
 
 
951 aa  292  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  33.11 
 
 
827 aa  291  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  31.99 
 
 
617 aa  290  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  33.12 
 
 
611 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  32.12 
 
 
597 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  32.06 
 
 
599 aa  283  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  30.38 
 
 
614 aa  282  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  31.86 
 
 
608 aa  277  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  31.86 
 
 
608 aa  277  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  30.88 
 
 
590 aa  276  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  30.16 
 
 
597 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  32.95 
 
 
611 aa  274  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  31.27 
 
 
630 aa  273  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  30.39 
 
 
830 aa  271  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  31.9 
 
 
595 aa  270  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  30.97 
 
 
608 aa  267  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  49.62 
 
 
271 aa  267  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  31.61 
 
 
832 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  53.23 
 
 
258 aa  266  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  52.82 
 
 
276 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  52.17 
 
 
261 aa  265  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  29.92 
 
 
616 aa  263  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  52.19 
 
 
334 aa  262  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  51.81 
 
 
255 aa  262  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  52.21 
 
 
256 aa  261  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  49.19 
 
 
250 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  31.16 
 
 
613 aa  259  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  49.19 
 
 
250 aa  259  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  51.21 
 
 
255 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  32.26 
 
 
954 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  48.24 
 
 
263 aa  257  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  50.2 
 
 
260 aa  257  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  50.6 
 
 
260 aa  256  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  50.6 
 
 
260 aa  256  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  47.08 
 
 
283 aa  256  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  50 
 
 
275 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  47.97 
 
 
333 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  50 
 
 
275 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  50 
 
 
275 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  49.8 
 
 
265 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  51.49 
 
 
294 aa  254  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.17 
 
 
596 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  47.18 
 
 
302 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  49.19 
 
 
250 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  48.16 
 
 
293 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
258 aa  253  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  50.2 
 
 
264 aa  253  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  47.18 
 
 
307 aa  252  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>