More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0913 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  60.21 
 
 		 678 aa  671    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  67.29 
 
 		 648 aa  839    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  95.67 
 
 		 646 aa  1150    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  70.74 
 
 		 647 aa  856    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  58.83 
 
 		 682 aa  656    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  66.98 
 
 		 643 aa  861    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  61.18 
 
 		 663 aa  753    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  100 
 
 		 646 aa  1293    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  60.94 
 
 		 679 aa  662    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  72.87 
 
 		 643 aa  929    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  44.94 
 
 		 652 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1697  ABC transporter-related protein  45.1 
 
 		 652 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2181  ABC branched-chain amino acid transporter, fused ATPase and inner-membrane subunits  44.3 
 
 		 652 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1684  ABC transporter related  37.77 
 
 		 629 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0459583  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  38.98 
 
 		 593 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  39.56 
 
 		 606 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  38.35 
 
 		 593 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0478  ABC transporter related  38.75 
 
 		 634 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  36.61 
 
 		 599 aa  348  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  34.31 
 
 		 616 aa  329  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  34.97 
 
 		 593 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  34.8 
 
 		 594 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  34.65 
 
 		 594 aa  323  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  32.79 
 
 		 589 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  34.63 
 
 		 594 aa  321  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.48 
 
 		 594 aa  321  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  34.38 
 
 		 594 aa  320  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  34.33 
 
 		 594 aa  319  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  35.4 
 
 		 823 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  34.22 
 
 		 594 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.84 
 
 		 594 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.84 
 
 		 594 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  34.84 
 
 		 594 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.84 
 
 		 594 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  35.22 
 
 		 951 aa  317  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  35.67 
 
 		 832 aa  317  6e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.69 
 
 		 594 aa  316  8e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  36.05 
 
 		 608 aa  316  8e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  34.69 
 
 		 594 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.69 
 
 		 594 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  36.26 
 
 		 608 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  36.26 
 
 		 608 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  35.34 
 
 		 823 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  34.26 
 
 		 608 aa  314  2.9999999999999996e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  35.69 
 
 		 660 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  35.28 
 
 		 597 aa  313  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  33.55 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  33.6 
 
 		 589 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  33.65 
 
 		 593 aa  310  5e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  33.64 
 
 		 830 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  33.96 
 
 		 617 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  33.86 
 
 		 594 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.7 
 
 		 594 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  35.38 
 
 		 827 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  33.54 
 
 		 594 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  34.07 
 
 		 604 aa  303  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  34.17 
 
 		 822 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  35.02 
 
 		 583 aa  302  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  34.28 
 
 		 614 aa  301  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  33.39 
 
 		 594 aa  301  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  33.82 
 
 		 950 aa  299  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  34.23 
 
 		 589 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 611 aa  296  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  35.09 
 
 		 608 aa  294  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  32.62 
 
 		 599 aa  293  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  33.55 
 
 		 590 aa  293  7e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  34.38 
 
 		 613 aa  293  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  34.34 
 
 		 589 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  32.27 
 
 		 590 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  35.7 
 
 		 611 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  33.23 
 
 		 589 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  33.65 
 
 		 588 aa  290  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  35.29 
 
 		 828 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  32.13 
 
 		 630 aa  286  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  31.48 
 
 		 616 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  30.81 
 
 		 582 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  31.93 
 
 		 597 aa  277  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  32.2 
 
 		 624 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.34 
 
 		 596 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  32.46 
 
 		 595 aa  268  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.12 
 
 		 609 aa  268  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  30.48 
 
 		 565 aa  267  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  54.62 
 
 		 265 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  31.22 
 
 		 603 aa  265  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  32.17 
 
 		 631 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  53.88 
 
 		 261 aa  265  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  51.45 
 
 		 276 aa  263  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  53.41 
 
 		 264 aa  262  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  51.6 
 
 		 260 aa  260  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  51.79 
 
 		 260 aa  261  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  51.6 
 
 		 260 aa  260  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  50.6 
 
 		 257 aa  260  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  49.6 
 
 		 251 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  50.2 
 
 		 257 aa  260  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  31.21 
 
 		 954 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  51.39 
 
 		 256 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  50.76 
 
 		 293 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  50 
 
 		 283 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  50 
 
 		 275 aa  258  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  51.17 
 
 		 275 aa  257  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>