More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3094 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  100 
 
 		 660 aa  1303    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  36.97 
 
 		 593 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  36.82 
 
 		 593 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  35.94 
 
 		 599 aa  337  5.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  35.17 
 
 		 663 aa  332  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  35.02 
 
 		 648 aa  326  9e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  33.04 
 
 		 643 aa  317  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  36.45 
 
 		 606 aa  302  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  32.33 
 
 		 643 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  32.78 
 
 		 614 aa  296  9e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  33.94 
 
 		 612 aa  294  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  34.46 
 
 		 589 aa  293  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  35.54 
 
 		 646 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.98 
 
 		 646 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  33.94 
 
 		 647 aa  290  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  34.29 
 
 		 608 aa  288  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  34.89 
 
 		 590 aa  283  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.88 
 
 		 594 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  34.83 
 
 		 590 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.88 
 
 		 594 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  33.88 
 
 		 594 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.88 
 
 		 594 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  33.88 
 
 		 594 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.88 
 
 		 594 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.88 
 
 		 594 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  32.16 
 
 		 603 aa  279  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  33.87 
 
 		 608 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  34.09 
 
 		 594 aa  277  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  34.63 
 
 		 589 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  46.06 
 
 		 398 aa  277  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  32.89 
 
 		 599 aa  276  7e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  33.76 
 
 		 598 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  35.36 
 
 		 604 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  32.13 
 
 		 594 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  33.28 
 
 		 611 aa  274  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  31.03 
 
 		 616 aa  273  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  32.13 
 
 		 594 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.32 
 
 		 594 aa  273  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  34.68 
 
 		 950 aa  272  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  32.13 
 
 		 594 aa  272  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  33.28 
 
 		 951 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  33.44 
 
 		 597 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  32.13 
 
 		 594 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  32.13 
 
 		 594 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  31.98 
 
 		 594 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  32.65 
 
 		 593 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  35.04 
 
 		 589 aa  270  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  33.97 
 
 		 624 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  32.58 
 
 		 589 aa  266  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  32.2 
 
 		 589 aa  266  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  32.74 
 
 		 583 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  32.05 
 
 		 594 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  33.68 
 
 		 679 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 611 aa  263  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  33.67 
 
 		 678 aa  263  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  32.15 
 
 		 593 aa  261  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  31.64 
 
 		 616 aa  261  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.54 
 
 		 594 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  31.41 
 
 		 594 aa  259  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  33.11 
 
 		 832 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  33.71 
 
 		 682 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.27 
 
 		 609 aa  254  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  50.79 
 
 		 264 aa  253  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  50.79 
 
 		 265 aa  252  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  35.95 
 
 		 652 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1697  ABC transporter-related protein  35.32 
 
 		 652 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  31.22 
 
 		 565 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  32.81 
 
 		 597 aa  251  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  46 
 
 		 263 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  33.44 
 
 		 830 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  31.46 
 
 		 852 aa  248  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1684  ABC transporter related  30.78 
 
 		 629 aa  247  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0459583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  30 
 
 		 603 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 255 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  33.5 
 
 		 823 aa  244  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  32.73 
 
 		 823 aa  243  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0097  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.31 
 
 		 302 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.232532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  34.98 
 
 		 822 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  33.18 
 
 		 590 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  46.99 
 
 		 271 aa  241  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  32.61 
 
 		 827 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  48.41 
 
 		 270 aa  239  9e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  32.41 
 
 		 617 aa  239  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  49.41 
 
 		 276 aa  237  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  42.89 
 
 		 384 aa  236  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  48.8 
 
 		 268 aa  236  9e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  43.86 
 
 		 389 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  34.19 
 
 		 586 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  29.21 
 
 		 582 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  44.15 
 
 		 389 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  43.4 
 
 		 389 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  42.78 
 
 		 389 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.19 
 
 		 596 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  33.11 
 
 		 604 aa  232  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5601  ABC transporter related protein  35.18 
 
 		 563 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 257 aa  232  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  31.23 
 
 		 840 aa  232  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  38.7 
 
 		 454 aa  232  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  32.45 
 
 		 595 aa  232  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  31.72 
 
 		 588 aa  231  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>