More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2318 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  100 
 
 
589 aa  1168    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  82.11 
 
 
590 aa  911    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  51.63 
 
 
950 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  55.44 
 
 
608 aa  564  1.0000000000000001e-159  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  50.09 
 
 
593 aa  559  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  50.34 
 
 
604 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  52.05 
 
 
613 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  48.23 
 
 
598 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  50.34 
 
 
617 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  48.99 
 
 
951 aa  537  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.25 
 
 
594 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  48.43 
 
 
594 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  48.25 
 
 
594 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  48.25 
 
 
594 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  48.6 
 
 
594 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  48.08 
 
 
594 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  47.73 
 
 
594 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  48.08 
 
 
594 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  48.93 
 
 
594 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  48.93 
 
 
594 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  48.21 
 
 
594 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  48.93 
 
 
594 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.03 
 
 
594 aa  525  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  48.93 
 
 
594 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  48.93 
 
 
594 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  48.21 
 
 
590 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  50.26 
 
 
608 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  50.26 
 
 
608 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  48.93 
 
 
594 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  48.93 
 
 
594 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  47.39 
 
 
594 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  48.61 
 
 
597 aa  519  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  47.67 
 
 
599 aa  521  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  48.43 
 
 
597 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  47.77 
 
 
589 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  49.74 
 
 
590 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  48.03 
 
 
583 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  48.04 
 
 
589 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  50 
 
 
590 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  48.04 
 
 
589 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  49.56 
 
 
608 aa  498  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  46.57 
 
 
589 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  47.59 
 
 
588 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  49.56 
 
 
595 aa  491  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  44.22 
 
 
630 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  46.48 
 
 
954 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  47.01 
 
 
604 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  48.31 
 
 
586 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  45.32 
 
 
631 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.57 
 
 
596 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  44.82 
 
 
625 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  36.35 
 
 
599 aa  334  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  38.29 
 
 
606 aa  324  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  38.11 
 
 
608 aa  317  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  34.39 
 
 
663 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  37.23 
 
 
593 aa  310  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  36.55 
 
 
593 aa  310  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  32.13 
 
 
643 aa  306  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  36.54 
 
 
611 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  38.02 
 
 
612 aa  298  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  34.45 
 
 
614 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  36.32 
 
 
611 aa  292  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  32.74 
 
 
646 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  32.42 
 
 
647 aa  291  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  34.63 
 
 
593 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  36.2 
 
 
832 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  36.68 
 
 
610 aa  288  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.74 
 
 
646 aa  287  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  34.68 
 
 
616 aa  286  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  33.72 
 
 
603 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  33.73 
 
 
582 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  36.95 
 
 
823 aa  282  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  37.13 
 
 
823 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  34.46 
 
 
660 aa  282  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  35.92 
 
 
830 aa  279  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  34.11 
 
 
565 aa  277  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  32.94 
 
 
616 aa  273  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  37.62 
 
 
827 aa  273  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  30.88 
 
 
648 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5601  ABC transporter related protein  34.97 
 
 
563 aa  270  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  33.91 
 
 
678 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  33.28 
 
 
679 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  35.79 
 
 
828 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  35.97 
 
 
822 aa  261  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.45 
 
 
609 aa  260  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  33.84 
 
 
682 aa  257  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  32.5 
 
 
852 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  33 
 
 
840 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  31.85 
 
 
632 aa  249  7e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  45.18 
 
 
307 aa  249  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  45.99 
 
 
302 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  32.37 
 
 
624 aa  246  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  49.61 
 
 
283 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  31.38 
 
 
603 aa  243  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
256 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  49.6 
 
 
255 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  49.22 
 
 
293 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  32.89 
 
 
621 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 
256 aa  239  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  49.4 
 
 
256 aa  239  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>