More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2941 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  58.01 
 
 		 593 aa  667    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  64.17 
 
 		 608 aa  667    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  60.86 
 
 		 594 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  75.25 
 
 		 951 aa  895    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  61.3 
 
 		 597 aa  653    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  72.03 
 
 		 950 aa  847    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  64.17 
 
 		 613 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  63.23 
 
 		 594 aa  718    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  61.02 
 
 		 594 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  64.33 
 
 		 608 aa  696    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  63.57 
 
 		 594 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  62.78 
 
 		 594 aa  719    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  66.61 
 
 		 599 aa  797    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  63.13 
 
 		 594 aa  707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  60.86 
 
 		 594 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  60.86 
 
 		 594 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  56.28 
 
 		 598 aa  647    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  60.17 
 
 		 630 aa  681    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  60.86 
 
 		 594 aa  709    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  100 
 
 		 604 aa  1187    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  62.61 
 
 		 594 aa  720    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  63.75 
 
 		 594 aa  726    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  61.84 
 
 		 594 aa  719    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  63.7 
 
 		 617 aa  705    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  80.07 
 
 		 597 aa  903    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  63.23 
 
 		 594 aa  721    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  61.02 
 
 		 594 aa  712    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  63.57 
 
 		 594 aa  725    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  63.23 
 
 		 594 aa  721    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  61.02 
 
 		 594 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  62.48 
 
 		 594 aa  720    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  64.33 
 
 		 608 aa  696    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  60.21 
 
 		 631 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  55.08 
 
 		 589 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  55.7 
 
 		 589 aa  619  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  54.39 
 
 		 590 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  60.85 
 
 		 625 aa  606  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  54.85 
 
 		 589 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  58.19 
 
 		 608 aa  608  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  56.76 
 
 		 588 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  53.71 
 
 		 954 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  52.92 
 
 		 590 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  52.27 
 
 		 589 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  54.43 
 
 		 590 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  55.83 
 
 		 595 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  49.92 
 
 		 583 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  55.05 
 
 		 586 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  50.35 
 
 		 589 aa  556  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  52.39 
 
 		 604 aa  540  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.25 
 
 		 596 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  50.41 
 
 		 590 aa  523  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  37.21 
 
 		 599 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  36.5 
 
 		 614 aa  320  7e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  34.79 
 
 		 643 aa  309  8e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  37.34 
 
 		 593 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  35.09 
 
 		 647 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  33.69 
 
 		 648 aa  297  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  33.69 
 
 		 663 aa  296  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  36.68 
 
 		 593 aa  293  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  37.52 
 
 		 606 aa  293  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  36.56 
 
 		 612 aa  285  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  33.07 
 
 		 646 aa  280  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.96 
 
 		 646 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  31.83 
 
 		 643 aa  274  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  33.83 
 
 		 593 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  35.74 
 
 		 608 aa  270  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  35.04 
 
 		 660 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  35.26 
 
 		 823 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  35.09 
 
 		 823 aa  264  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  33.9 
 
 		 610 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  36.89 
 
 		 827 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  34.11 
 
 		 621 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  36.06 
 
 		 832 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2146  ABC transporter related  32.62 
 
 		 606 aa  257  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  33.22 
 
 		 632 aa  257  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 611 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  34.93 
 
 		 616 aa  254  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  34.69 
 
 		 679 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  34.58 
 
 		 611 aa  253  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  34.01 
 
 		 582 aa  253  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  34.56 
 
 		 678 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  34.08 
 
 		 616 aa  251  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  35.11 
 
 		 822 aa  251  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  31.79 
 
 		 565 aa  249  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  33.74 
 
 		 682 aa  248  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  33.33 
 
 		 830 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5601  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 563 aa  246  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 		 256 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  34.19 
 
 		 624 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  31.79 
 
 		 603 aa  244  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  52.8 
 
 		 276 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  49.41 
 
 		 256 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  50.78 
 
 		 270 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  49.21 
 
 		 256 aa  240  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  30.37 
 
 		 625 aa  240  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  36.13 
 
 		 828 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  49.82 
 
 		 333 aa  238  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  50.8 
 
 		 261 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  49.81 
 
 		 334 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  46.23 
 
 		 307 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>