More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1994 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  59.28 
 
 		 594 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  56.23 
 
 		 593 aa  635    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  60.58 
 
 		 594 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  59.28 
 
 		 594 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  59.28 
 
 		 594 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  59.28 
 
 		 594 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  100 
 
 		 590 aa  1164    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  59.45 
 
 		 594 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  59.45 
 
 		 594 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  59.97 
 
 		 594 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  59.83 
 
 		 594 aa  682    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  59.79 
 
 		 594 aa  671    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  90.17 
 
 		 589 aa  1046    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  55.4 
 
 		 598 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  59.28 
 
 		 594 aa  678    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  88.31 
 
 		 589 aa  1014    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  79.32 
 
 		 589 aa  914    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  61.51 
 
 		 594 aa  690    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  60.58 
 
 		 594 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  60.41 
 
 		 594 aa  687    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  59.45 
 
 		 594 aa  670    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  60.58 
 
 		 594 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  59.62 
 
 		 594 aa  679    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  60.24 
 
 		 594 aa  683    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  56.07 
 
 		 950 aa  633  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  57.82 
 
 		 590 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  58.36 
 
 		 617 aa  626  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  58.63 
 
 		 590 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  58.32 
 
 		 608 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  58.32 
 
 		 608 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  55.94 
 
 		 597 aa  608  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  58.7 
 
 		 613 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  55.71 
 
 		 597 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  54.79 
 
 		 604 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  53.55 
 
 		 951 aa  594  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  53.11 
 
 		 599 aa  585  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  58.02 
 
 		 608 aa  585  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  55.52 
 
 		 608 aa  578  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  53.97 
 
 		 630 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  52.39 
 
 		 583 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  52.17 
 
 		 588 aa  561  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  51.92 
 
 		 589 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  52.48 
 
 		 954 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  52.64 
 
 		 631 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  55.85 
 
 		 586 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  49.02 
 
 		 589 aa  522  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  50.26 
 
 		 595 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.7 
 
 		 596 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  48.36 
 
 		 604 aa  507  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  53.08 
 
 		 625 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  48.76 
 
 		 590 aa  487  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  35.45 
 
 		 614 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  36.92 
 
 		 599 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  35.7 
 
 		 593 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  36.82 
 
 		 608 aa  289  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  38.13 
 
 		 612 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 610 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  31.84 
 
 		 648 aa  272  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  35.43 
 
 		 593 aa  272  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  32.37 
 
 		 663 aa  270  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  36.86 
 
 		 823 aa  269  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 611 aa  270  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  37.68 
 
 		 832 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  36.61 
 
 		 823 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5601  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 563 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  36.71 
 
 		 611 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  31.56 
 
 		 643 aa  266  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  34.92 
 
 		 593 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  35.71 
 
 		 606 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  34.89 
 
 		 616 aa  262  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  32.1 
 
 		 646 aa  262  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  35.18 
 
 		 830 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  34.88 
 
 		 616 aa  260  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  34.8 
 
 		 660 aa  259  7e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2146  ABC transporter related  35.28 
 
 		 606 aa  259  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  36.18 
 
 		 827 aa  256  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  32.98 
 
 		 603 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  33.5 
 
 		 582 aa  252  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  35.9 
 
 		 822 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  32.91 
 
 		 679 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  51 
 
 		 257 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  51 
 
 		 257 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  48.8 
 
 		 255 aa  242  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  49.2 
 
 		 255 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  30.98 
 
 		 565 aa  239  8e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  35.03 
 
 		 828 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  34.38 
 
 		 594 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  32.01 
 
 		 682 aa  238  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  51.81 
 
 		 252 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 		 256 aa  234  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  48.59 
 
 		 255 aa  234  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  33.51 
 
 		 852 aa  233  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  33.23 
 
 		 678 aa  233  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  49.21 
 
 		 256 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  48 
 
 		 255 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  47.98 
 
 		 256 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  48.79 
 
 		 255 aa  231  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  32.04 
 
 		 652 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  49.21 
 
 		 280 aa  230  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  48.79 
 
 		 253 aa  229  8e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>