More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1820 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  54.65 
 
 
593 aa  653    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  58.28 
 
 
608 aa  651    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  100 
 
 
599 aa  1199    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  57.09 
 
 
594 aa  680    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  56.93 
 
 
594 aa  679    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  66.61 
 
 
951 aa  792    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  63.15 
 
 
950 aa  770    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  58.61 
 
 
613 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  57.09 
 
 
594 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  56.57 
 
 
594 aa  680    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  57.09 
 
 
594 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  56.06 
 
 
594 aa  675    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  56.9 
 
 
594 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  56.93 
 
 
594 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  56.73 
 
 
594 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  58.28 
 
 
608 aa  651    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  55.89 
 
 
594 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  69.44 
 
 
597 aa  801    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  57.98 
 
 
631 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  58.51 
 
 
617 aa  661    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  57.24 
 
 
594 aa  684    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  56.93 
 
 
594 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  56.9 
 
 
594 aa  687    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  55.79 
 
 
630 aa  646    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  56.9 
 
 
594 aa  682    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  56.93 
 
 
594 aa  679    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  56.73 
 
 
594 aa  685    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  56.57 
 
 
594 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  56.4 
 
 
594 aa  670    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  66.89 
 
 
604 aa  797    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  52.95 
 
 
598 aa  630  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  58.29 
 
 
608 aa  624  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  56.6 
 
 
597 aa  624  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  54.51 
 
 
589 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  53.11 
 
 
590 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  53.47 
 
 
589 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  51.91 
 
 
589 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  53.34 
 
 
588 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  52.84 
 
 
954 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  56.07 
 
 
625 aa  572  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  49.15 
 
 
589 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  52.53 
 
 
608 aa  570  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  49.31 
 
 
590 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  52.35 
 
 
595 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  49.13 
 
 
590 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  47.41 
 
 
583 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
589 aa  540  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  51.39 
 
 
586 aa  538  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  48.56 
 
 
604 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.2 
 
 
596 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  49.13 
 
 
590 aa  511  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  37.44 
 
 
614 aa  348  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  35.27 
 
 
599 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  32.93 
 
 
643 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  32.88 
 
 
663 aa  310  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  33.74 
 
 
647 aa  302  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  33.03 
 
 
648 aa  296  6e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  34.93 
 
 
606 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  34.82 
 
 
593 aa  289  8e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  35.53 
 
 
593 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  34.13 
 
 
612 aa  285  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  35.27 
 
 
608 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  34.64 
 
 
610 aa  281  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  34 
 
 
593 aa  280  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  34.61 
 
 
611 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  34.12 
 
 
679 aa  273  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  31.91 
 
 
646 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  33.17 
 
 
660 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  35.06 
 
 
678 aa  269  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  31.98 
 
 
643 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  35.11 
 
 
611 aa  266  8e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  32.89 
 
 
616 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2146  ABC transporter related  31.51 
 
 
606 aa  264  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.17 
 
 
646 aa  263  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  31.62 
 
 
682 aa  261  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  31.24 
 
 
565 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  31.03 
 
 
582 aa  256  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  34.03 
 
 
832 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  31.97 
 
 
830 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  31.06 
 
 
652 aa  254  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1697  ABC transporter-related protein  31.21 
 
 
652 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
257 aa  252  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  34.49 
 
 
823 aa  251  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  34.43 
 
 
823 aa  251  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  33.86 
 
 
822 aa  251  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  31.8 
 
 
621 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  50.2 
 
 
257 aa  250  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5601  ABC transporter related protein  34.53 
 
 
563 aa  249  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2181  ABC branched-chain amino acid transporter, fused ATPase and inner-membrane subunits  30.43 
 
 
652 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  31.76 
 
 
616 aa  247  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  33.82 
 
 
827 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  29.72 
 
 
625 aa  246  8e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 
256 aa  244  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  30.46 
 
 
603 aa  243  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.58 
 
 
609 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  31.57 
 
 
632 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  31.5 
 
 
594 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  32.44 
 
 
624 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  46.99 
 
 
261 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  46.22 
 
 
258 aa  233  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>