More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0733 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  85.21 
 
 		 594 aa  993    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  100 
 
 		 597 aa  1195    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  37.52 
 
 		 842 aa  327  6e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  37.37 
 
 		 859 aa  321  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  36.35 
 
 		 838 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  35.7 
 
 		 621 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  37.82 
 
 		 852 aa  300  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  32.55 
 
 		 632 aa  297  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  32.84 
 
 		 625 aa  287  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  38.07 
 
 		 840 aa  279  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  38.38 
 
 		 840 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  47.57 
 
 		 340 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  34.27 
 
 		 840 aa  269  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  34.07 
 
 		 598 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  48.42 
 
 		 335 aa  266  8.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  46.15 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  48.39 
 
 		 340 aa  263  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  47.81 
 
 		 322 aa  257  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  31.81 
 
 		 593 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  47.3 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  36.88 
 
 		 823 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  54.96 
 
 		 250 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  33.22 
 
 		 597 aa  251  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  32.57 
 
 		 606 aa  251  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  32.71 
 
 		 593 aa  250  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  46.22 
 
 		 346 aa  250  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  49.68 
 
 		 337 aa  249  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  32.89 
 
 		 590 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  31.89 
 
 		 594 aa  248  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  32.78 
 
 		 594 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  34.07 
 
 		 589 aa  248  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  33.33 
 
 		 589 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  32.61 
 
 		 594 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  32.61 
 
 		 594 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  32.83 
 
 		 594 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  33 
 
 		 594 aa  246  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.83 
 
 		 594 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.83 
 
 		 594 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.83 
 
 		 594 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.89 
 
 		 594 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  32.45 
 
 		 594 aa  246  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  32.78 
 
 		 594 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.67 
 
 		 594 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  32.67 
 
 		 594 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  46.53 
 
 		 343 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  54.13 
 
 		 250 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  52.48 
 
 		 254 aa  244  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  35.78 
 
 		 823 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.67 
 
 		 594 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6071  ABC transporter related  29.66 
 
 		 615 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.461067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  32.78 
 
 		 594 aa  244  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.95 
 
 		 594 aa  243  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  31.13 
 
 		 594 aa  243  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  32.08 
 
 		 589 aa  243  9e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  46.25 
 
 		 333 aa  243  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  32.28 
 
 		 951 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  34.12 
 
 		 589 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  32.88 
 
 		 589 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  33.63 
 
 		 608 aa  241  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  35.19 
 
 		 863 aa  239  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  48.28 
 
 		 361 aa  237  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  36.31 
 
 		 827 aa  237  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  33.97 
 
 		 595 aa  235  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  32 
 
 		 830 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  32.61 
 
 		 617 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  34.8 
 
 		 822 aa  233  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  50.4 
 
 		 253 aa  233  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  50 
 
 		 251 aa  233  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  33.16 
 
 		 630 aa  233  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  31.53 
 
 		 647 aa  232  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  44.76 
 
 		 321 aa  231  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  49.58 
 
 		 255 aa  231  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  32.08 
 
 		 950 aa  230  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  47.98 
 
 		 252 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  48.8 
 
 		 257 aa  229  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  31.98 
 
 		 663 aa  228  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  32.36 
 
 		 597 aa  227  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  30.73 
 
 		 593 aa  227  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  31.86 
 
 		 599 aa  226  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  34.98 
 
 		 631 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  30.19 
 
 		 643 aa  226  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  43.94 
 
 		 338 aa  225  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  48.78 
 
 		 252 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  48.15 
 
 		 255 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0085  inner-membrane translocator  46.15 
 
 		 324 aa  223  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  34.5 
 
 		 608 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  49.39 
 
 		 252 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  47.39 
 
 		 258 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  31.18 
 
 		 583 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  33.68 
 
 		 590 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  29.67 
 
 		 646 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 		 282 aa  219  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  31.26 
 
 		 832 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  33.39 
 
 		 954 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  33.56 
 
 		 590 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  34.69 
 
 		 625 aa  218  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  32.07 
 
 		 614 aa  218  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  31.5 
 
 		 593 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  47.13 
 
 		 257 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  29.79 
 
 		 648 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>