More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4747 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  517  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  78.26 
 
 		 250 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  76.28 
 
 		 250 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  75.79 
 
 		 254 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  68.87 
 
 		 257 aa  357  7e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  56.85 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  57.54 
 
 		 251 aa  276  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  55.6 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  55.78 
 
 		 255 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  54.58 
 
 		 257 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  54.4 
 
 		 252 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  55.82 
 
 		 252 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  53.39 
 
 		 258 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  55.02 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  54 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  54.66 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  55.2 
 
 		 248 aa  250  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.27 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  50.4 
 
 		 597 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  46.43 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  47.18 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  49 
 
 		 594 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  46.61 
 
 		 250 aa  224  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  47.18 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  48.39 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  45.67 
 
 		 251 aa  220  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  48.79 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  45.85 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  46.99 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  45.34 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.69 
 
 		 250 aa  205  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  44.31 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.68 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.69 
 
 		 250 aa  204  9e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  45.56 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  45.56 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  42.06 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  46.43 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  43.78 
 
 		 250 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  46.22 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  42.86 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  41.5 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  41.04 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  44.21 
 
 		 272 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  43.48 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  41.87 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  42.63 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  42.28 
 
 		 838 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  43.5 
 
 		 484 aa  198  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  42.4 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  41.27 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  40.64 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  40.64 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  43.9 
 
 		 840 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  40.24 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  46.96 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  42.46 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  41.83 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  38.96 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  41.83 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  42.69 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  42.74 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  40.96 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  42.21 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  41.18 
 
 		 256 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  42.5 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  41.94 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.85 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  39.84 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  43.25 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  41.77 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  40.24 
 
 		 268 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  40.16 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  39.04 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  40.16 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  38.96 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  41.7 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  41.43 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  44.98 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  40.49 
 
 		 249 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  41.46 
 
 		 266 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  39.27 
 
 		 840 aa  191  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  41.46 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  45.12 
 
 		 852 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  43.72 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  38.96 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3715  ABC transporter related  40.87 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  41.2 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  41.18 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  40.08 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  38.8 
 
 		 265 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  39.68 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.32 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>