More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2892 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  100 
 
 
266 aa  524  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  50.97 
 
 
271 aa  236  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  47.62 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.02 
 
 
255 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  44.62 
 
 
255 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  47.52 
 
 
272 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 
257 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  45.6 
 
 
257 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46 
 
 
257 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 
257 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 
257 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 
257 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.6 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.2 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.2 
 
 
257 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  44.92 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  44.92 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  45.38 
 
 
256 aa  219  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  44.62 
 
 
255 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  44.62 
 
 
255 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  44.62 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  42.21 
 
 
625 aa  219  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  47.04 
 
 
271 aa  218  7e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  45.56 
 
 
267 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
277 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  44.98 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  44.58 
 
 
254 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  46.59 
 
 
255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  41.7 
 
 
250 aa  214  9e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  44.4 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  46.06 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.12 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  45.67 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  44.18 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  46.61 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  43.37 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  43.95 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  43.15 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  44.58 
 
 
256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  45.78 
 
 
256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  45.38 
 
 
256 aa  212  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  43.15 
 
 
253 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.72 
 
 
250 aa  211  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  44.72 
 
 
256 aa  211  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  44.72 
 
 
256 aa  211  9e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  45.93 
 
 
256 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  43.37 
 
 
255 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  44.27 
 
 
254 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  43.98 
 
 
259 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  46.77 
 
 
252 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 
256 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  45.02 
 
 
256 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  45.02 
 
 
256 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  45.02 
 
 
250 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  43.9 
 
 
246 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  45.78 
 
 
253 aa  209  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  44.4 
 
 
259 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 
254 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  43.37 
 
 
254 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  45.02 
 
 
257 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  44.31 
 
 
255 aa  208  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  45.02 
 
 
256 aa  208  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  43.09 
 
 
255 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  45.38 
 
 
255 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  43.75 
 
 
278 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  44.49 
 
 
268 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.62 
 
 
255 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  45.78 
 
 
250 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  43.09 
 
 
250 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  44.12 
 
 
266 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  44.62 
 
 
252 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  44.05 
 
 
256 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 
250 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  38.49 
 
 
257 aa  205  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  44.4 
 
 
258 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  45.12 
 
 
250 aa  205  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  45.8 
 
 
253 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  42.68 
 
 
251 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 
250 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  44.9 
 
 
248 aa  205  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  40.96 
 
 
260 aa  205  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  44.12 
 
 
249 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  44.22 
 
 
263 aa  204  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  45.16 
 
 
262 aa  204  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.25 
 
 
251 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 
259 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  43.28 
 
 
249 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  44.62 
 
 
257 aa  204  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  39.84 
 
 
253 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  43.27 
 
 
258 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  40.96 
 
 
254 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  43.7 
 
 
262 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  45.83 
 
 
249 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  45.8 
 
 
250 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  45.02 
 
 
259 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  43.28 
 
 
249 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  43.09 
 
 
252 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  45.02 
 
 
259 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  42.97 
 
 
263 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>