More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3209 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  519  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  64.54 
 
 		 251 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.26 
 
 		 250 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  64.26 
 
 		 250 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  55.28 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  55.28 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  55.28 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  54.88 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  54.88 
 
 		 255 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  53.25 
 
 		 255 aa  271  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  51.61 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  51.61 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  52.87 
 
 		 273 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4753  ABC transporter-related protein  52.63 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  53.25 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  53.04 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  52.23 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1584  ABC transporter related  53.66 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  45.53 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  45.6 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  44.76 
 
 		 267 aa  215  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 271 aa  214  8e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  40.16 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  41.63 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  40.56 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  40.56 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  40.73 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  42.57 
 
 		 250 aa  208  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  40.71 
 
 		 278 aa  208  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  41.6 
 
 		 268 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  42.23 
 
 		 277 aa  208  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  40.48 
 
 		 252 aa  208  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  40.32 
 
 		 251 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  41.6 
 
 		 256 aa  208  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  42.63 
 
 		 263 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  40.73 
 
 		 256 aa  207  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  41.6 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1716  ABC transporter related  39.51 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  45.3 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  41.32 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  41.6 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  41.13 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  41.2 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  41.6 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  39.84 
 
 		 266 aa  204  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  41.46 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  40.96 
 
 		 253 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  40.32 
 
 		 251 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  41.2 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  41.13 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  40.82 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  40.32 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1435  ABC transporter related  42.11 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.446323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  41.94 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  38.71 
 
 		 256 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  39.52 
 
 		 256 aa  201  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  40 
 
 		 261 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  39.52 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  39.52 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  37.96 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  40 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.98 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  39.43 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  39.09 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.82 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  40.82 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  41.53 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  40.48 
 
 		 258 aa  198  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  40 
 
 		 258 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  41.3 
 
 		 246 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  41.98 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  40.41 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  41.2 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  39.09 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  39.92 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  38.71 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  43.37 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  39.59 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 271 aa  195  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  41.2 
 
 		 253 aa  195  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  39.51 
 
 		 257 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  39.51 
 
 		 257 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  39.6 
 
 		 250 aa  194  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  39.75 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  41.3 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  39.75 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  40.96 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3291  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  40.33 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  40.98 
 
 		 250 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 		 271 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  40.08 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.97 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.58 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  39.74 
 
 		 240 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  38.06 
 
 		 261 aa  191  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>