More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0662 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  99.6 
 
 		 250 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  99.2 
 
 		 250 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  64.54 
 
 		 253 aa  349  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  60.57 
 
 		 259 aa  296  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  58.7 
 
 		 255 aa  288  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  60.33 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  57.89 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  58.3 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4753  ABC transporter-related protein  58.61 
 
 		 257 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  58.06 
 
 		 255 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  58.06 
 
 		 255 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  58.06 
 
 		 255 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  58.54 
 
 		 259 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  56.22 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  56.22 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  56.45 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1584  ABC transporter related  57.89 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  47.6 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  46.77 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  42.17 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  41.94 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  42.34 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  46.15 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  42.8 
 
 		 250 aa  208  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  42.51 
 
 		 255 aa  209  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  46 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  44.58 
 
 		 252 aa  208  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 		 250 aa  208  8e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  41.94 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  43.27 
 
 		 261 aa  205  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  43.67 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  43.27 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 249 aa  204  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  42.8 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  41.98 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  42.4 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.32 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  44.8 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  40.16 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  40.16 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  42.63 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  38.96 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  43.6 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.09 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  40.32 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  40.73 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  41.13 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  41.13 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  42.86 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  42.4 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  40.74 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  43.2 
 
 		 249 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  42.4 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  41.94 
 
 		 254 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  42.34 
 
 		 254 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  44.58 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  42.17 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  42.51 
 
 		 263 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  42.11 
 
 		 258 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  42.34 
 
 		 254 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  42.34 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  41.87 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  42.98 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  41.7 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  42.68 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  40.56 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  44.44 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  40.5 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 		 257 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.44 
 
 		 233 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  40.73 
 
 		 251 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 		 257 aa  194  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  41.53 
 
 		 250 aa  194  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  38.62 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  42.51 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  40.98 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  41.7 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  40.96 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  40.49 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  41.53 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  42.91 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  42.74 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 271 aa  192  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1435  ABC transporter related  41.39 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.446323 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  40.33 
 
 		 271 aa  191  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 271 aa  191  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  40.65 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>