More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0546 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  511  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  80.32 
 
 		 256 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  80.72 
 
 		 256 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  80.32 
 
 		 256 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  78.31 
 
 		 252 aa  391  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.59 
 
 		 251 aa  342  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  58.65 
 
 		 272 aa  278  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  47.64 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  50.6 
 
 		 859 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  48.37 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  47.56 
 
 		 254 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.33 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  47.52 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  46.06 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  46.06 
 
 		 254 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  44.84 
 
 		 259 aa  224  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  46.69 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  46.28 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  48.82 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0330  ABC transporter related  45.06 
 
 		 292 aa  220  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  47.97 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  46.28 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  47.06 
 
 		 621 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  45.56 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  47.13 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  47.79 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  45.49 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  47.97 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  47.58 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  45.31 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  47.35 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  44.31 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  40.64 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  44.84 
 
 		 259 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  42.58 
 
 		 271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  44.31 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  44.9 
 
 		 259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  47.33 
 
 		 250 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  43.32 
 
 		 263 aa  211  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  41.9 
 
 		 256 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  46.5 
 
 		 250 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  42.8 
 
 		 251 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  44.94 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.49 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  46.56 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  46.56 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  46.56 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  43.95 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  44.03 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  42.91 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  46.69 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  42.51 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  47.35 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.51 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  44.03 
 
 		 259 aa  208  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  45.67 
 
 		 252 aa  208  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1773  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  45.38 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547469  normal  0.0486237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 		 256 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  42.34 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.44 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  43.85 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  43.78 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  41.6 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  41.2 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  44.03 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  43.98 
 
 		 264 aa  205  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  45.49 
 
 		 252 aa  205  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  44.18 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  43.72 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  42.8 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  45.27 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  44.18 
 
 		 262 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  42.8 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.27 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  43.85 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1584  ABC transporter related  43.09 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  45.53 
 
 		 250 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.45 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.45 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.45 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.45 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  43.08 
 
 		 283 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.45 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  47.74 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2927  ABC transporter related  43.21 
 
 		 258 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0722568  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  42.35 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  43.27 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  46.8 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  43.27 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  43.27 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4753  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  42.68 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  44.22 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  45.93 
 
 		 246 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>