More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1989 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  60.08 
 
 		 250 aa  299  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  55.02 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  60.64 
 
 		 255 aa  275  6e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  56.9 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  54.84 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 		 256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  54.44 
 
 		 251 aa  258  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  53.69 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  52.59 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  51.42 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  57.61 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  50.8 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  57.14 
 
 		 249 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  55.87 
 
 		 250 aa  241  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  48.19 
 
 		 249 aa  235  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  53.14 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  53.41 
 
 		 254 aa  228  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  49.19 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  51.23 
 
 		 251 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  48 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  45.34 
 
 		 258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  46.12 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  47.76 
 
 		 246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  56.3 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 250 aa  218  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  48.52 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  45.19 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  49.8 
 
 		 251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  45.97 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  46.22 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  45.49 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  42.11 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  45.49 
 
 		 250 aa  208  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  46.09 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  45.3 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  43.55 
 
 		 251 aa  204  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  42.06 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  44.03 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  46.15 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  46 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  45.27 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  44.94 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  44.18 
 
 		 250 aa  201  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  42.62 
 
 		 250 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  45.1 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  43.48 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  43.6 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  41.98 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  43.2 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  44.49 
 
 		 257 aa  197  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  41.56 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  42.15 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  46.72 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  45.04 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  43.64 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  42.28 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  46.28 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  43.08 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  40.08 
 
 		 625 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  43.08 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  43.08 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  42.24 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  44.18 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  39.43 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1335  ABC transporter related  43.37 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0569483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  43.78 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  43.78 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  43.78 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.03 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  43.57 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  43.9 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  45.45 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  45.87 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  43.8 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  43.8 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  41.49 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  42.68 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  40.24 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  42.56 
 
 		 859 aa  188  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1296  ABC transporter related  42.97 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  41.95 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  42.5 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  41.13 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4753  ABC transporter-related protein  41.53 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  39.43 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.58 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  41.84 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  41.3 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  39.34 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  43.03 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  39.34 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  42.32 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  41.46 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  41.46 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>